More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3150 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  71.37 
 
 
475 aa  719  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  88.4 
 
 
474 aa  885  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  69.94 
 
 
479 aa  690  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  98.52 
 
 
474 aa  970  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  72.69 
 
 
476 aa  733  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 
479 aa  745  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 
473 aa  696  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  982  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  98.52 
 
 
474 aa  969  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 
473 aa  674  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  88.19 
 
 
474 aa  884  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  88.19 
 
 
474 aa  883  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  86.92 
 
 
474 aa  877  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  91.35 
 
 
474 aa  908  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  88.4 
 
 
474 aa  883  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  71.52 
 
 
474 aa  712  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 
475 aa  693  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 
481 aa  562  1e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
476 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  55.36 
 
 
476 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
476 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
476 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  55.21 
 
 
470 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
476 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.68 
 
 
471 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  53.06 
 
 
474 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
475 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
480 aa  517  1e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  52.62 
 
 
476 aa  505  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
475 aa  491  1e-138  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
480 aa  492  1e-138  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  52.71 
 
 
470 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  51.15 
 
 
485 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
472 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  49.03 
 
 
480 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  48.82 
 
 
480 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  48.94 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  48.37 
 
 
478 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
480 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
472 aa  447  1e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
475 aa  445  1e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  46.61 
 
 
472 aa  446  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
490 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
487 aa  439  1e-122  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  46.85 
 
 
477 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
491 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
510 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
491 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  48.21 
 
 
491 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  44.91 
 
 
483 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
476 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
479 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
484 aa  415  1e-115  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  46.15 
 
 
467 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
465 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
476 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  46.68 
 
 
466 aa  408  1e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  46.2 
 
 
469 aa  408  1e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
475 aa  408  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  45.51 
 
 
470 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  43.38 
 
 
474 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  44.67 
 
 
462 aa  401  1e-110  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  44.13 
 
 
479 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  44.11 
 
 
479 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 
481 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  44.44 
 
 
469 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  42.43 
 
 
496 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
494 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  42.48 
 
 
472 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
460 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
511 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
490 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
472 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  44.54 
 
 
472 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
473 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
483 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
477 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  41.63 
 
 
473 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
477 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  44.78 
 
 
478 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
477 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  42.96 
 
 
498 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  40.91 
 
 
473 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  42.34 
 
 
477 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  41.52 
 
 
459 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2009  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
493 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  41.15 
 
 
462 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  41.87 
 
 
465 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2652  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
459 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.309423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>