93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3085 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  99.65 
 
 
287 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
287 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  95.82 
 
 
304 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  89.2 
 
 
304 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
304 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
287 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
287 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
288 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  75.09 
 
 
268 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  54.81 
 
 
311 aa  337  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  50 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  51.71 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  56.09 
 
 
294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  48.61 
 
 
291 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  32.43 
 
 
292 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
280 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 
280 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
280 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  24.91 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  26.77 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  25.61 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  25.44 
 
 
274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  25.44 
 
 
274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  25.53 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  25.53 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  25.53 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 
248 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.13 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  28.14 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  26.63 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  26.63 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  26.63 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  22.5 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  27.21 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  22.5 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  29.69 
 
 
491 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.11 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  21.03 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  21.03 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  21.03 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  21.03 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  21.03 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  21.03 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  21.03 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  21.03 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  22.76 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.18 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  26.8 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  21.72 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  28.39 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  24.52 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  26.45 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  27.56 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  24.86 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  22.05 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  22.96 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  20.87 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  23.12 
 
 
257 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  27.07 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  25.32 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  23.78 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  23.78 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  23.17 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  23.3 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  23.17 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  22.78 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  19.56 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  25.16 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24.41 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  24.83 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  19.13 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  23.42 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  23.85 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  23.84 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  21.43 
 
 
247 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>