123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3083 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  100 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  99.47 
 
 		 189 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  98.94 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  97.88 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  95.7 
 
 		 187 aa  361  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  95.16 
 
 		 187 aa  360  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  95.7 
 
 		 187 aa  360  9e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  90.76 
 
 		 209 aa  343  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  95.7 
 
 		 187 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  95.7 
 
 		 187 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  87.3 
 
 		 203 aa  332  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  87.23 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  86.84 
 
 		 203 aa  329  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  88.04 
 
 		 197 aa  326  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  85.11 
 
 		 197 aa  322  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  87.83 
 
 		 200 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  84.41 
 
 		 196 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  82.54 
 
 		 199 aa  317  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  70.88 
 
 		 183 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  69.78 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  69.78 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  67.23 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  65.76 
 
 		 203 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  65.76 
 
 		 203 aa  241  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  65.76 
 
 		 203 aa  241  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  63.64 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  65.56 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  64.13 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  64.13 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  64.13 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  64.13 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  64.48 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  63.78 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  62.63 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  68.68 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  63.59 
 
 		 188 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  63.04 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  65.76 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.57 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  62.36 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  61.24 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  56.48 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  65.03 
 
 		 194 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  61.08 
 
 		 199 aa  208  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  59.78 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  56.91 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.91 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.91 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  60 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  57.3 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.49 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.22 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  60.11 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  60.77 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  56.98 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  55.91 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.86 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.16 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  43.65 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  44.32 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.7 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  47.57 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1100  GPR1/FUN34/yaaH family protein  46.37 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.679326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.34 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.49 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.03 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.43 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.67 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.4 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  35.16 
 
 		 197 aa  111  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  36.7 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.12 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.86 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.74 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  38.25 
 
 		 258 aa  98.6  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.34 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.68 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  35.57 
 
 		 283 aa  91.7  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.3 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.32 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  31.25 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.161215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  35.75 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0383  GPR1/FUN34/YaaH family protein  30.81 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1604  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00253793  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3336  hypothetical protein  29.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000909805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  29.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3650  hypothetical protein  29.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1667  hypothetical protein  29.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  hitchhiker  6.45658e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  29.57 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>