162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2686 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  100 
 
 
252 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  99.21 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  98.02 
 
 
252 aa  510  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  92 
 
 
252 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  88 
 
 
254 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  87.25 
 
 
251 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  88 
 
 
254 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  88.4 
 
 
254 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  88.4 
 
 
254 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  75.3 
 
 
251 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  77.24 
 
 
246 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  73.33 
 
 
249 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  71.54 
 
 
248 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  71.25 
 
 
247 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  74.3 
 
 
260 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  63.93 
 
 
245 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  64.34 
 
 
245 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  63.16 
 
 
245 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  64.75 
 
 
245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  62.3 
 
 
245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  62.3 
 
 
245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  61.13 
 
 
245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  62.3 
 
 
245 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  61.54 
 
 
245 aa  315  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  62.7 
 
 
245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  61.48 
 
 
245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  61.48 
 
 
245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  61.48 
 
 
245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  61.48 
 
 
245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  61.48 
 
 
245 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  63.11 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  57.26 
 
 
244 aa  293  2e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  50.63 
 
 
245 aa  244  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  48.4 
 
 
248 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  51.34 
 
 
241 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  48.18 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  49.38 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  45.64 
 
 
251 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  45.2 
 
 
250 aa  224  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  44.86 
 
 
251 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  42.86 
 
 
238 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  42.02 
 
 
239 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  43.78 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  42.74 
 
 
248 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  41.1 
 
 
240 aa  190  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  42.49 
 
 
240 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  43.1 
 
 
239 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  42.55 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  39.22 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  42.31 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  39.56 
 
 
244 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  36.29 
 
 
242 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  33.47 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  32.47 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  32.94 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  28.19 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.57 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  28.02 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  30.39 
 
 
573 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.65 
 
 
580 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  31.19 
 
 
584 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.54 
 
 
574 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.95 
 
 
579 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.57 
 
 
574 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.86 
 
 
577 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  26.57 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 
586 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  33.94 
 
 
586 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  30.24 
 
 
557 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  25.61 
 
 
578 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  29.46 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  25.21 
 
 
598 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 
576 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  26.03 
 
 
594 aa  65.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  26.03 
 
 
578 aa  65.9  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  30.2 
 
 
570 aa  65.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  27.6 
 
 
347 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.54 
 
 
588 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  28.57 
 
 
543 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  29 
 
 
570 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  31.86 
 
 
570 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 
560 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  30.88 
 
 
592 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.69 
 
 
614 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  26.17 
 
 
381 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  29.41 
 
 
580 aa  62.4  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  28.08 
 
 
569 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  29.47 
 
 
580 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  27.75 
 
 
574 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  26.42 
 
 
562 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  21.66 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  28.23 
 
 
586 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>