257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2595 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  100 
 
 
231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  98.7 
 
 
255 aa  447  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  97.84 
 
 
255 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  91.3 
 
 
230 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  88.7 
 
 
285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  91.82 
 
 
293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  88.36 
 
 
273 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  88.26 
 
 
273 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  88.36 
 
 
273 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  77.5 
 
 
286 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  78.5 
 
 
238 aa  347  7e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  76.89 
 
 
245 aa  331  6e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  60.66 
 
 
247 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  59.43 
 
 
237 aa  258  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  57.01 
 
 
236 aa  254  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  60.78 
 
 
239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  56.81 
 
 
252 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  56.34 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  55.14 
 
 
232 aa  214  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  54.72 
 
 
230 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  54.25 
 
 
230 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  54.25 
 
 
230 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  54.25 
 
 
233 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  49.52 
 
 
242 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  47.91 
 
 
246 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  44.86 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  44.44 
 
 
244 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  43.52 
 
 
244 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  40 
 
 
258 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.86 
 
 
244 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  36.67 
 
 
253 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  36.19 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  38.94 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.36 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  33.65 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.62 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  42.94 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  37.8 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  42.94 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  38.76 
 
 
255 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  38.76 
 
 
280 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  42.17 
 
 
292 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  38.76 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  34.22 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  31.65 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  34.08 
 
 
246 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.77 
 
 
228 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  35.32 
 
 
247 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  33.03 
 
 
233 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  33.18 
 
 
229 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  36.19 
 
 
243 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  30.87 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  30.09 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.09 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  29.72 
 
 
235 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  29.72 
 
 
235 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  35.71 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.24 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  34.95 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.13 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  30.33 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  31.07 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  30.58 
 
 
243 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  32.26 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  29.36 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  34.21 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  34.21 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  34.21 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  30.22 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.48 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  33.68 
 
 
241 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  30.11 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.15 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  34.21 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  31.02 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.68 
 
 
240 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.48 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.02 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  28.37 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  31.96 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.93 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.47 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.17 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  30.47 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.47 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  29.28 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.63 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  27.36 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  34.34 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  28.71 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  29.61 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  26.54 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  38.92 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.62 
 
 
307 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  31.35 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  32.77 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  31.6 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  29.65 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  29.65 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  29.65 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>