More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2345 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  97.06 
 
 
204 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  95.59 
 
 
204 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  82.84 
 
 
204 aa  362  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  79.6 
 
 
204 aa  349  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  79.6 
 
 
204 aa  347  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  79.1 
 
 
204 aa  344  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  79.1 
 
 
204 aa  344  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  76.12 
 
 
205 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  51.47 
 
 
202 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  41.09 
 
 
203 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  39.89 
 
 
207 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  41.08 
 
 
202 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.9 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  42.25 
 
 
208 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  41.71 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  37.61 
 
 
347 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.1 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.41 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.53 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.13 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
256 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  33.96 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
320 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  36.45 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
341 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.74 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  42.06 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  28.15 
 
 
829 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  43.4 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1567  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.21 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00051335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.06 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.18 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.2 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.87 
 
 
312 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.01 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
328 aa  64.7  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.87 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  33.87 
 
 
256 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
365 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  33.87 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1605  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.05 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000158565  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1352  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1535  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.05 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000727979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
1106 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
271 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1462  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.05 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  34.68 
 
 
292 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
634 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 
273 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3246  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
255 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00392072  normal  0.0412956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>