53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2342 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  237  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  236  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  93.28 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  93.28 
 
 		 119 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  94.07 
 
 		 119 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  92.44 
 
 		 119 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  92.44 
 
 		 119 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  79.66 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  77.97 
 
 		 135 aa  193  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  73.73 
 
 		 119 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  71.19 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  74.58 
 
 		 119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  69.49 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  70.09 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  45.76 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  51.43 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  47.22 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  44.66 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  39.09 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0859  hypothetical protein  35.85 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  40.96 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  40.96 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  38.55 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  37.35 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  30.17 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  32.95 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  30.63 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  34.94 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  34.94 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  36.14 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  33.73 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  30.77 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  28.7 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  31.31 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  31.4 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1738  hypothetical protein  21.43 
 
 		 221 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  29 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 702 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>