79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2295 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  100 
 
 
596 aa  1244    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  86.74 
 
 
595 aa  1111    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  69.01 
 
 
594 aa  898    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  84.56 
 
 
592 aa  1083    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  65.38 
 
 
595 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  86.58 
 
 
595 aa  1110    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  61.91 
 
 
594 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  99.5 
 
 
596 aa  1239    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  65.16 
 
 
594 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  65.66 
 
 
596 aa  843    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  99.66 
 
 
596 aa  1240    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  86.41 
 
 
595 aa  1107    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  67.72 
 
 
604 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  65.05 
 
 
595 aa  844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  93.62 
 
 
596 aa  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  86.91 
 
 
595 aa  1112    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  35.1 
 
 
602 aa  369  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  34.27 
 
 
602 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  34.29 
 
 
600 aa  362  8e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.66 
 
 
601 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  32.02 
 
 
593 aa  296  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  31.07 
 
 
586 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  31.07 
 
 
586 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  31.14 
 
 
595 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  30.91 
 
 
598 aa  294  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  30.91 
 
 
598 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  30.91 
 
 
598 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  30.91 
 
 
586 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  31.19 
 
 
586 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  31.03 
 
 
586 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  31.02 
 
 
586 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  31.02 
 
 
586 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  31.02 
 
 
586 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  30.43 
 
 
580 aa  288  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  30.48 
 
 
586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  30.79 
 
 
590 aa  277  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  29.37 
 
 
582 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.59 
 
 
582 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  29.64 
 
 
590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  30.42 
 
 
613 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.23 
 
 
617 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.23 
 
 
617 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.16 
 
 
615 aa  225  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  28.7 
 
 
611 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  27.95 
 
 
609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.16 
 
 
622 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  23.42 
 
 
647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  23.8 
 
 
638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.34 
 
 
637 aa  183  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.17 
 
 
637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  24.62 
 
 
600 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.42 
 
 
607 aa  180  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  27.27 
 
 
586 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  26.9 
 
 
607 aa  173  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  24.84 
 
 
635 aa  167  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.84 
 
 
638 aa  167  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.9 
 
 
625 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  31.29 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  29.32 
 
 
624 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  29.43 
 
 
508 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  27.93 
 
 
614 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  23.99 
 
 
642 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  23.95 
 
 
641 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.77 
 
 
621 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  24.23 
 
 
621 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.26 
 
 
621 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  20.95 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  25.38 
 
 
429 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.32 
 
 
597 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  39.13 
 
 
665 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2987  sulfatase  22.88 
 
 
657 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000085975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  22.33 
 
 
873 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  27.19 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>