184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2287 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  98.83 
 
 
186 aa  350  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  98.83 
 
 
171 aa  348  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  97.08 
 
 
171 aa  345  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  85.38 
 
 
188 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  83.04 
 
 
171 aa  307  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  85.96 
 
 
188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  85.96 
 
 
188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  85.96 
 
 
188 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.57 
 
 
179 aa  255  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  80.14 
 
 
171 aa  254  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  69.57 
 
 
167 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  76.76 
 
 
179 aa  248  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  70.97 
 
 
194 aa  247  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  72.26 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  72.14 
 
 
165 aa  230  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  48.24 
 
 
187 aa  167  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  48.34 
 
 
157 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.37 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  55.78 
 
 
153 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  47.44 
 
 
158 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  50.66 
 
 
160 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  51.01 
 
 
171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  48.63 
 
 
160 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  51.82 
 
 
146 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  46.95 
 
 
166 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  46.95 
 
 
166 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  45.03 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  43.6 
 
 
208 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  47.83 
 
 
166 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.44 
 
 
187 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  43.75 
 
 
180 aa  140  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.2 
 
 
167 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  49.65 
 
 
171 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  45.73 
 
 
167 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.36 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  46.85 
 
 
168 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.1 
 
 
331 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.21 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 
337 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.43 
 
 
334 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.97 
 
 
331 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.86 
 
 
175 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  46.76 
 
 
188 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  44.76 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  44.76 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  45 
 
 
341 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  43.45 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.34 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  44.76 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  45.45 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.59 
 
 
179 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.32 
 
 
169 aa  120  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.04 
 
 
192 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  42.55 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  42.25 
 
 
309 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.74 
 
 
164 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  40.12 
 
 
166 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  38.97 
 
 
171 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  42.45 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.45 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  39.44 
 
 
178 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.85 
 
 
209 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  30.19 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  58.18 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.86 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.38 
 
 
241 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.19 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  42.22 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  27.67 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.07 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  27.67 
 
 
281 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.67 
 
 
281 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  27.33 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
244 aa  63.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.33 
 
 
217 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
247 aa  61.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
241 aa  60.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.86 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.39 
 
 
449 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  33.83 
 
 
494 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.92 
 
 
252 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.74 
 
 
244 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  28.85 
 
 
462 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  28.85 
 
 
462 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  29.14 
 
 
475 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.43 
 
 
415 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  29.46 
 
 
246 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  29.8 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.8 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.19 
 
 
437 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  38.16 
 
 
122 aa  54.7  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  29.6 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  30.07 
 
 
492 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>