73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2276 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  99.06 
 
 
229 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2409  sortase family protein  92.89 
 
 
197 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0892648  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2196  LPXTG-site transpeptidase family protein  84.04 
 
 
228 aa  333  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1844  sortase family protein  72.56 
 
 
234 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1830  sortase family protein  72.3 
 
 
232 aa  320  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.27273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  73.56 
 
 
234 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1878  sortase family protein  71.16 
 
 
234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0907818  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  82.95 
 
 
204 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  61.54 
 
 
206 aa  224  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2515  sortase family protein  56.35 
 
 
229 aa  218  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.348325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  54.97 
 
 
208 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2125  sortase family protein  56.08 
 
 
201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217102  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1794  sortase family protein  53.37 
 
 
266 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.32656  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  50.27 
 
 
214 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  38.73 
 
 
244 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  43 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  42.39 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  38.5 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  42.11 
 
 
195 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  37.5 
 
 
196 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0663  hypothetical protein  36.76 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0826254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1394  sortase family protein  36.56 
 
 
203 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2739  sortase family protein  36.02 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686756  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  35.71 
 
 
207 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2999  sortase family protein  35.12 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0632399  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5162  sortase family protein  33.89 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  35.71 
 
 
207 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3380  putative sortase family protein  31.77 
 
 
185 aa  101  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5133  peptidase C60 sortase A and B  35.47 
 
 
193 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.61 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.15 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.13 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  31.17 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.34 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.27 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.34 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30.58 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.34 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  26.26 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  26.62 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  25.18 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  27.27 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.75 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  32.2 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.75 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  27.27 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  27.27 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  35.23 
 
 
302 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  22.22 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  39.8 
 
 
354 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.64 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  24.62 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.46 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  26.94 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.71 
 
 
350 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  26.76 
 
 
265 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  31.43 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  33.01 
 
 
251 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  31.43 
 
 
249 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  36.04 
 
 
218 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  27 
 
 
556 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  36.36 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  24.53 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  32.69 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  31.17 
 
 
321 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  35 
 
 
298 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.48 
 
 
323 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  32.5 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.14 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  30.7 
 
 
521 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.77 
 
 
222 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  29.41 
 
 
242 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>