More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2230 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  89.65 
 
 		 367 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  91.09 
 
 		 506 aa  979    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  83.6 
 
 		 506 aa  872    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  94.66 
 
 		 506 aa  1009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  83.79 
 
 		 506 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  99.21 
 
 		 506 aa  1044    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  100 
 
 		 506 aa  1050    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  82.97 
 
 		 506 aa  867    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  86.56 
 
 		 506 aa  910    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  55.62 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  57.45 
 
 		 494 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  47.9 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  48.22 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  47.11 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  46.71 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  45.71 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  45.38 
 
 		 519 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  44.55 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  41.83 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  42.48 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  42.5 
 
 		 506 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  42.29 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  43.13 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  41.11 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.68 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  42.28 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  40 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  39.96 
 
 		 517 aa  349  8e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  40.81 
 
 		 517 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  39.73 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  40.85 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.72 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  39.24 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  37.68 
 
 		 500 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.28 
 
 		 515 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  37.43 
 
 		 521 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.82 
 
 		 518 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.15 
 
 		 483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  36.68 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  35.99 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  31.97 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0251  flavocytochrome c  86.67 
 
 		 161 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  34.65 
 
 		 599 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  34.19 
 
 		 609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  33.4 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  33.27 
 
 		 515 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  33.21 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.39 
 
 		 584 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  32.22 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  32.22 
 
 		 582 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.99 
 
 		 586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  31.82 
 
 		 606 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  31.53 
 
 		 605 aa  199  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  33.4 
 
 		 582 aa  193  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  31.67 
 
 		 603 aa  189  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.71 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.71 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.71 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.71 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.81 
 
 		 596 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.43 
 
 		 597 aa  186  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  32.59 
 
 		 591 aa  186  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.58 
 
 		 596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  31.54 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  31.54 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.65 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.58 
 
 		 596 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.08 
 
 		 598 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.27 
 
 		 588 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.81 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.78 
 
 		 596 aa  163  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  27.6 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  31.44 
 
 		 608 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  31.14 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.05 
 
 		 593 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  30.89 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.75 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  28.97 
 
 		 596 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.16 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.46 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.28 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  30.22 
 
 		 596 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  30.63 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.03 
 
 		 598 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.99 
 
 		 631 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.59 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.83 
 
 		 650 aa  150  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.71 
 
 		 598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.65 
 
 		 597 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.52 
 
 		 925 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  27.88 
 
 		 635 aa  143  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.52 
 
 		 504 aa  143  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  29.17 
 
 		 957 aa  141  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.57 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.02 
 
 		 589 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.75 
 
 		 925 aa  136  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.35 
 
 		 616 aa  136  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>