More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2211 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  69.59 
 
 		 786 aa  964    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  55.81 
 
 		 641 aa  735    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  95.93 
 
 		 665 aa  1323    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 665 aa  1382    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  57.94 
 
 		 639 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  68.51 
 
 		 774 aa  971    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  56.31 
 
 		 654 aa  784    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  92.02 
 
 		 686 aa  1261    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  70.33 
 
 		 778 aa  976    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  58.52 
 
 		 631 aa  799    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  68.04 
 
 		 765 aa  974    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  50.08 
 
 		 683 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  43.69 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 		 620 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  39.68 
 
 		 609 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  40.1 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  37.78 
 
 		 619 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  38.46 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  32.13 
 
 		 610 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.51 
 
 		 511 aa  193  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 510 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.48 
 
 		 620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.89 
 
 		 1021 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.06 
 
 		 600 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2158  hypothetical protein  71.58 
 
 		 108 aa  140  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 838 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.7 
 
 		 599 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.4 
 
 		 1855 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  27.13 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 562 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.29 
 
 		 584 aa  134  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 836 aa  134  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 614 aa  133  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.57 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  28.07 
 
 		 574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.72 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  25.81 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 		 588 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 528 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  26.4 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  27.77 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  26.65 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.3 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.83 
 
 		 2068 aa  126  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 583 aa  126  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  26.65 
 
 		 589 aa  125  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 582 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.76 
 
 		 588 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 814 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.36 
 
 		 462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.75 
 
 		 526 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.36 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.32 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.27 
 
 		 1175 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  25.69 
 
 		 622 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.59 
 
 		 515 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.93 
 
 		 1891 aa  117  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  25.24 
 
 		 571 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  30.85 
 
 		 715 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.68 
 
 		 885 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  26.05 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.01 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.94 
 
 		 484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.52 
 
 		 1942 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  25.52 
 
 		 564 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 593 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.53 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 586 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.13 
 
 		 477 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.06 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.15 
 
 		 595 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.49 
 
 		 635 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  23.79 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  23.62 
 
 		 575 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  23.16 
 
 		 654 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 622 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  28.53 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  24.75 
 
 		 686 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  23.94 
 
 		 472 aa  108  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  25.14 
 
 		 686 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.75 
 
 		 2638 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  22.57 
 
 		 606 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  25.06 
 
 		 752 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 		 739 aa  107  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  23.26 
 
 		 586 aa  107  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 649 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 578 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.38 
 
 		 1975 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  23.71 
 
 		 586 aa  104  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  24.14 
 
 		 586 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25.16 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.96 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>