121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2145 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  93.96 
 
 
182 aa  347  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  86.81 
 
 
182 aa  337  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  86.81 
 
 
182 aa  337  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  86.81 
 
 
182 aa  337  6e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  86.81 
 
 
182 aa  337  6e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  86.81 
 
 
182 aa  321  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  70.88 
 
 
182 aa  285  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  71.98 
 
 
182 aa  283  1e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  69.78 
 
 
182 aa  282  2e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  69.23 
 
 
183 aa  279  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  74.85 
 
 
163 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  70.76 
 
 
171 aa  258  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  68.1 
 
 
163 aa  240  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  50.28 
 
 
182 aa  172  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  50.28 
 
 
182 aa  172  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  50.28 
 
 
182 aa  172  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  50.28 
 
 
182 aa  172  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  50.57 
 
 
182 aa  172  3e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.01636e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  50.28 
 
 
182 aa  172  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  49.15 
 
 
182 aa  167  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  48.3 
 
 
183 aa  164  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  49.15 
 
 
195 aa  163  1e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  47.75 
 
 
183 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  47.43 
 
 
186 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  48.3 
 
 
183 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  50.84 
 
 
179 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  49.45 
 
 
187 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  48.8 
 
 
169 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.59341e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  46.86 
 
 
182 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  46.86 
 
 
182 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  46.86 
 
 
182 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  46.86 
 
 
182 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  46.29 
 
 
182 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  45.71 
 
 
182 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  45.14 
 
 
182 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  45.71 
 
 
182 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  46.45 
 
 
187 aa  148  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  49.72 
 
 
178 aa  146  1e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  48.65 
 
 
497 aa  146  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  47.97 
 
 
502 aa  145  2e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  47.62 
 
 
540 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  45.35 
 
 
608 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  45.25 
 
 
659 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  45.25 
 
 
637 aa  144  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  46.62 
 
 
541 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  46.43 
 
 
458 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  47.62 
 
 
529 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  46.43 
 
 
452 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  43.39 
 
 
189 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  47.74 
 
 
635 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  49.32 
 
 
184 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  5.49055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  42.86 
 
 
190 aa  138  5e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  46.94 
 
 
589 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  47.1 
 
 
205 aa  137  8e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  37.99 
 
 
659 aa  137  9e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  46.15 
 
 
636 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  46.15 
 
 
597 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  40.49 
 
 
625 aa  135  3e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  45.51 
 
 
598 aa  135  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  47.62 
 
 
203 aa  135  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  40.68 
 
 
189 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  44.14 
 
 
195 aa  134  7e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  45.33 
 
 
544 aa  134  7e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  41.57 
 
 
187 aa  134  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  45.33 
 
 
526 aa  132  2e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  38.98 
 
 
212 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  38.98 
 
 
188 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  38.98 
 
 
188 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  46 
 
 
529 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  41.89 
 
 
496 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  41.89 
 
 
496 aa  131  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  41.22 
 
 
502 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  131  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.27212e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  48.28 
 
 
225 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  40.54 
 
 
499 aa  130  1e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  40.4 
 
 
186 aa  128  5e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  47.22 
 
 
186 aa  128  5e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  47.22 
 
 
229 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  44.9 
 
 
190 aa  125  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  45.21 
 
 
190 aa  125  4e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  40.41 
 
 
188 aa  124  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  45.21 
 
 
186 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  40.4 
 
 
185 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  41.78 
 
 
186 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  42.36 
 
 
187 aa  119  2e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  38.51 
 
 
501 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  38.51 
 
 
510 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1799  protein of unknown function DUF882  43.33 
 
 
187 aa  108  4e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  37.84 
 
 
194 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>