More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2075 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  51.63 
 
 		 817 aa  806    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  78.26 
 
 		 853 aa  1349    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  67.44 
 
 		 836 aa  1184    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  78.95 
 
 		 853 aa  1338    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  73.22 
 
 		 843 aa  1277    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  74.24 
 
 		 841 aa  1286    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  78.38 
 
 		 853 aa  1352    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  78.26 
 
 		 853 aa  1349    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  82.88 
 
 		 709 aa  1096    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  99.88 
 
 		 855 aa  1735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 855 aa  1737    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  69.77 
 
 		 839 aa  1211    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  70.16 
 
 		 842 aa  1220    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  82.75 
 
 		 838 aa  1432    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  79.52 
 
 		 853 aa  1366    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  41.52 
 
 		 869 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 873 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  39.78 
 
 		 873 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 930 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 930 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 937 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 933 aa  432  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 935 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 935 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 935 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.45 
 
 		 936 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 935 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 904 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 904 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 897 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 904 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 904 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 901 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 981 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 924 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 		 966 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 907 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 966 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 907 aa  343  8e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 938 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 952 aa  332  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 953 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 891 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 966 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 944 aa  314  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 912 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 935 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 944 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1088 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 872 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 974 aa  305  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 957 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 967 aa  303  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 890 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 985 aa  294  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 946 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 869 aa  293  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 890 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 855 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 975 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 890 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 987 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 951 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 852 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 909 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 951 aa  283  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 910 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 896 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 909 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 871 aa  280  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 947 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 981 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 876 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 966 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 882 aa  274  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 869 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 882 aa  273  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 948 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 847 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 969 aa  271  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 964 aa  269  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 924 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 924 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 924 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.2 
 
 		 929 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 861 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 861 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 861 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 886 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 894 aa  265  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  30.74 
 
 		 827 aa  264  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 849 aa  263  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 886 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 861 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 892 aa  262  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 961 aa  262  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 861 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 857 aa  258  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.76 
 
 		 880 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>