More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2010 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  99.19 
 
 		 124 aa  238  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  97.58 
 
 		 124 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  97.58 
 
 		 124 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  96.77 
 
 		 124 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  96.77 
 
 		 124 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  94.35 
 
 		 124 aa  229  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  83.87 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  82.26 
 
 		 124 aa  207  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  81.45 
 
 		 124 aa  206  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  72.58 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  77.24 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  53.04 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  50.86 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  49.17 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  54.05 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  47.83 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.07 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.5 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  50.94 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  40.68 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.39 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  49.51 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.22 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.97 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  44.79 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.48 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  45.61 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  45.79 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  42.15 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  41.8 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.84 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.33 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  39.66 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.03 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.88 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.46 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  39.42 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42.86 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  38.66 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  44.23 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  43.81 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.61 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.75 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>