More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1987 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  100 
 
 		 500 aa  1005    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  100 
 
 		 499 aa  1005    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  99.4 
 
 		 499 aa  1000    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  90.38 
 
 		 499 aa  917    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  88.98 
 
 		 499 aa  905    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  57.69 
 
 		 501 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  54.66 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  54.86 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  53.82 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.83 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  52.83 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  52.72 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  51.92 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  52.52 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  52.52 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.43 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  51.62 
 
 		 523 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  52.02 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  48.5 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  50.7 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  54.14 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  52.02 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  52.02 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  50.7 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  51.82 
 
 		 506 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  50.81 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  51.7 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  51.7 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  50.4 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  50.81 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  51.31 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  49.8 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  50.4 
 
 		 502 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  50.1 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  50 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 511 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.28 
 
 		 513 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  51.62 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 529 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  47.89 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  48.21 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.2 
 
 		 522 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  45.49 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.82 
 
 		 544 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.09 
 
 		 519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  45.45 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  42.08 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.37 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  44.37 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  44.37 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.19 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.01 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.09 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.65 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.76 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.04 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  40.04 
 
 		 500 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.03 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.82 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.54 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.84 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.88 
 
 		 512 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.16 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  39.8 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.21 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  39.92 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 523 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.88 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.07 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  39.68 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 508 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.47 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.87 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.02 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  40.88 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.84 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.11 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.88 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>