More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1880 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  245  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  98.35 
 
 
121 aa  243  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  97.52 
 
 
121 aa  241  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  95.04 
 
 
121 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  94.21 
 
 
121 aa  237  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  94.21 
 
 
121 aa  237  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  94.21 
 
 
121 aa  237  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  92.56 
 
 
121 aa  232  1e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  72.73 
 
 
121 aa  187  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  69.17 
 
 
121 aa  178  3e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  62.81 
 
 
121 aa  158  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  58.68 
 
 
121 aa  153  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  60 
 
 
121 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  60 
 
 
121 aa  151  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  57.76 
 
 
120 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  59.66 
 
 
120 aa  144  4e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  59.48 
 
 
120 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  56.3 
 
 
120 aa  143  7e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  57.85 
 
 
121 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  55.37 
 
 
128 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  58.47 
 
 
120 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  56.2 
 
 
121 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  57.14 
 
 
120 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  56.3 
 
 
120 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
121 aa  139  1e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
121 aa  139  2e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  55.08 
 
 
120 aa  136  8e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  55.37 
 
 
122 aa  136  9e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  55.37 
 
 
121 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  55.28 
 
 
121 aa  135  3e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
120 aa  135  3e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  54.55 
 
 
122 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
122 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  53.45 
 
 
116 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  132  1e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  53.85 
 
 
120 aa  132  1e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  48.33 
 
 
122 aa  132  2e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  54.55 
 
 
121 aa  132  2e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  56.03 
 
 
120 aa  132  2e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  48.33 
 
 
122 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
120 aa  130  4e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
120 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  52.94 
 
 
121 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  52.07 
 
 
121 aa  130  7e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  52.07 
 
 
121 aa  130  7e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  52.07 
 
 
121 aa  130  8e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  53.72 
 
 
121 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  51.26 
 
 
121 aa  129  1e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  52.54 
 
 
120 aa  129  1e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  51.67 
 
 
123 aa  129  2e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  55.83 
 
 
120 aa  128  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
120 aa  128  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  49.17 
 
 
120 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  51.28 
 
 
119 aa  126  1e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
120 aa  125  2e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  48.74 
 
 
120 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
120 aa  124  4e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
120 aa  124  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  47.9 
 
 
123 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
120 aa  123  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  50.82 
 
 
120 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  47.01 
 
 
121 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  51.26 
 
 
120 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.59905e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  49.59 
 
 
122 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  49.59 
 
 
121 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  49.18 
 
 
122 aa  121  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  44.72 
 
 
124 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
125 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  50.42 
 
 
125 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 
122 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  47.9 
 
 
125 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 
122 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
121 aa  119  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  47.93 
 
 
121 aa  119  1e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
122 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
122 aa  119  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 
123 aa  118  2e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  117  5e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
125 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  49.56 
 
 
126 aa  116  8e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 
118 aa  116  1e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
125 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
121 aa  116  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  49.56 
 
 
126 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
125 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
125 aa  116  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
121 aa  116  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
125 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
125 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  50.44 
 
 
137 aa  113  8e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  50.44 
 
 
137 aa  113  8e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  45.69 
 
 
121 aa  112  1e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>