More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1867 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  99.26 
 
 		 136 aa  278  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  99.26 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  97.79 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  95.59 
 
 		 165 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  94.85 
 
 		 136 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  94.85 
 
 		 136 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  94.85 
 
 		 136 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  94.12 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  94.12 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  83.82 
 
 		 136 aa  244  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  86.76 
 
 		 136 aa  243  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  82.35 
 
 		 136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  81.62 
 
 		 136 aa  240  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  83.09 
 
 		 136 aa  237  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  77.94 
 
 		 136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  78.68 
 
 		 136 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  76.87 
 
 		 135 aa  206  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  76.12 
 
 		 146 aa  206  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  73.13 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  71.64 
 
 		 136 aa  203  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  72.39 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  72.39 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  73.13 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  71.64 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  70.68 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  74.22 
 
 		 138 aa  197  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  74.63 
 
 		 136 aa  196  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  74.22 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  74.22 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  70.9 
 
 		 135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  72.39 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  70.15 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  71.64 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  72.66 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  71.64 
 
 		 135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  71.88 
 
 		 129 aa  193  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  69.92 
 
 		 138 aa  193  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  192  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  70.9 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  70.45 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  67.91 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  65.67 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  68.18 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  67.42 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  69.53 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  62.41 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  63.36 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  70.31 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  68.75 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  66.92 
 
 		 132 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  68 
 
 		 128 aa  176  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  67.19 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  65.87 
 
 		 144 aa  176  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  67.19 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  65.6 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  65.62 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  63.64 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  65.62 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  65.08 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  64.84 
 
 		 128 aa  173  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  63.2 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  63.28 
 
 		 143 aa  172  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  63.28 
 
 		 143 aa  172  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  64.84 
 
 		 238 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  66.41 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  66.94 
 
 		 127 aa  170  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  62.02 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  62.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  63.28 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  62.79 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  61.72 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  63.28 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  58.78 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  61.42 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  62.5 
 
 		 128 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2733  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 		 127 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2094  glyoxalase I  68.5 
 
 		 127 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2706  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 		 127 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  59.84 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  59.38 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  64.06 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>