More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1856 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  99.67 
 
 
303 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  99.34 
 
 
313 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  96.7 
 
 
303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  90.76 
 
 
303 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  90.43 
 
 
303 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  91.09 
 
 
303 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  88.12 
 
 
303 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  91.09 
 
 
303 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  91.09 
 
 
303 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  77.63 
 
 
303 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  76.64 
 
 
303 aa  484  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  76.24 
 
 
303 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  73.74 
 
 
309 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  73.51 
 
 
303 aa  454  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  75.76 
 
 
315 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  72.94 
 
 
303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  60.4 
 
 
305 aa  364  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  56.69 
 
 
315 aa  348  9e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  62.79 
 
 
312 aa  347  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  58.82 
 
 
303 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  53.5 
 
 
350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  62.68 
 
 
305 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  58.98 
 
 
305 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  61.89 
 
 
305 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.54 
 
 
300 aa  331  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.27 
 
 
331 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  57.67 
 
 
308 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  56.55 
 
 
308 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  62.02 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  54.52 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  53.72 
 
 
315 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  56.32 
 
 
306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  61.54 
 
 
305 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  61.19 
 
 
305 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  55.48 
 
 
302 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  58.39 
 
 
303 aa  322  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  59 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.48 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.67 
 
 
323 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.67 
 
 
323 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  54.42 
 
 
317 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.08 
 
 
317 aa  316  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  57.6 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  60.87 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  55.43 
 
 
306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.8 
 
 
306 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  58.33 
 
 
306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  58.19 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.19 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  56.23 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  55.87 
 
 
304 aa  305  6e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.63 
 
 
335 aa  305  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  52.01 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  51.16 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  51.15 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  52.5 
 
 
306 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.15 
 
 
305 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  51 
 
 
306 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  55.26 
 
 
317 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  51.09 
 
 
347 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  54.71 
 
 
310 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.13 
 
 
314 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.64 
 
 
306 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  54.64 
 
 
306 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.31 
 
 
308 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  50.88 
 
 
310 aa  291  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.11 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.42 
 
 
319 aa  288  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.46 
 
 
310 aa  288  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.82 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.19 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.26 
 
 
305 aa  285  8e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.16 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  45.58 
 
 
327 aa  281  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.13 
 
 
330 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.46 
 
 
302 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.46 
 
 
318 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  44.59 
 
 
302 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  53.93 
 
 
349 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
302 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  45.55 
 
 
305 aa  276  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.78 
 
 
321 aa  275  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  50.92 
 
 
328 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  43.48 
 
 
320 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  43.14 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  44.93 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.49 
 
 
341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  43.27 
 
 
308 aa  273  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  42.52 
 
 
318 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.18 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  46.91 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.4 
 
 
314 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
321 aa  270  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  44.91 
 
 
320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.61 
 
 
327 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.7 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  48.57 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>