30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1809 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  95.32 
 
 
341 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  97.08 
 
 
343 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  82.46 
 
 
332 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  69.3 
 
 
336 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  67.84 
 
 
333 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  67.25 
 
 
333 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  67.54 
 
 
333 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  66.96 
 
 
333 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  41.35 
 
 
315 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  41.64 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  40.06 
 
 
382 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  39.69 
 
 
335 aa  242  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  38.3 
 
 
312 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  38.78 
 
 
312 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  36.09 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  29.68 
 
 
243 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  28.95 
 
 
242 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  26.29 
 
 
296 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  26.47 
 
 
475 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  26.42 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  36.61 
 
 
565 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02438  hypothetical protein  28.85 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.477602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1357  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1167  hypothetical protein  31.82 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000681695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  22.11 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1778  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1777  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>