More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1564 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  94.91 
 
 		 884 aa  1722    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 883 aa  1806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 883 aa  1806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  98.98 
 
 		 883 aa  1788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 891 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 924 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 924 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 924 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 872 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 876 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  32.01 
 
 		 895 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 868 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  31.22 
 
 		 899 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 882 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 882 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 892 aa  360  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 896 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  31.56 
 
 		 893 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 869 aa  352  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 886 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 886 aa  351  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 890 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 890 aa  347  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 890 aa  344  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 875 aa  340  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 800 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 849 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 852 aa  327  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 861 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 861 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 861 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 857 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 861 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 861 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 861 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 855 aa  321  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  32.29 
 
 		 827 aa  321  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 847 aa  319  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 894 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 909 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 909 aa  308  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 907 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 871 aa  299  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 901 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 938 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 904 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 935 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 896 aa  287  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  30.51 
 
 		 877 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  29.76 
 
 		 866 aa  280  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 867 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 867 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 867 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 907 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 867 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 935 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 935 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 935 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 924 aa  270  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  28.89 
 
 		 880 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 884 aa  263  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 879 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 866 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 874 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 967 aa  255  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 910 aa  255  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 953 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 873 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  27.28 
 
 		 936 aa  247  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 912 aa  247  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 873 aa  246  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 948 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 853 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 853 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 853 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 948 aa  241  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 869 aa  239  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 951 aa  240  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 957 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 981 aa  233  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.07 
 
 		 853 aa  231  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 947 aa  231  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 841 aa  230  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 904 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 894 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.31 
 
 		 839 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 946 aa  225  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 836 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 904 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  26.52 
 
 		 834 aa  221  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 904 aa  221  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 904 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 944 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1088 aa  218  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 855 aa  217  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 927 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 952 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 846 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>