More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1548 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  96.95 
 
 
296 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  97.29 
 
 
296 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  85.76 
 
 
296 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  71.04 
 
 
297 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  67.68 
 
 
297 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  68.01 
 
 
297 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  67.68 
 
 
297 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  67.34 
 
 
297 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  63.39 
 
 
299 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  59.8 
 
 
295 aa  358  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  59.02 
 
 
307 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  56.39 
 
 
307 aa  346  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  55.48 
 
 
301 aa  345  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  55.93 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  53.44 
 
 
309 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  55.18 
 
 
302 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  55.18 
 
 
302 aa  315  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  55.18 
 
 
302 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  53.87 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  51.52 
 
 
301 aa  299  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  52.01 
 
 
297 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  47.44 
 
 
294 aa  295  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  51.18 
 
 
297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  51.84 
 
 
301 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  51.18 
 
 
297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  49.34 
 
 
301 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  51.18 
 
 
297 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  51.18 
 
 
297 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  50.51 
 
 
302 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  51.18 
 
 
297 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  50.84 
 
 
297 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  50.51 
 
 
297 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  50.51 
 
 
297 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  50.51 
 
 
297 aa  290  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  50.51 
 
 
297 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  50.51 
 
 
297 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  51.17 
 
 
301 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  49.83 
 
 
297 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  50.17 
 
 
297 aa  289  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  50.17 
 
 
297 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  49.5 
 
 
304 aa  288  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.49 
 
 
297 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  49.5 
 
 
304 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  50.83 
 
 
316 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  47 
 
 
300 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  45.67 
 
 
309 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  44.3 
 
 
296 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  48.16 
 
 
298 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  46 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  43.24 
 
 
295 aa  238  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  42.86 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  43.04 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  41.64 
 
 
306 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  40.39 
 
 
306 aa  234  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  40.39 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  39.53 
 
 
302 aa  231  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  42.81 
 
 
306 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  43 
 
 
300 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  39.47 
 
 
308 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  39.02 
 
 
308 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  39.02 
 
 
308 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  42.33 
 
 
300 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.49 
 
 
299 aa  225  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  39.48 
 
 
309 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.62 
 
 
301 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03426  cell division inhibitor  48.5 
 
 
295 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  39.29 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  39.35 
 
 
309 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  44.93 
 
 
478 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.75 
 
 
301 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  42.19 
 
 
298 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  39.8 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  42.68 
 
 
316 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  42.19 
 
 
298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  41.23 
 
 
308 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  43.67 
 
 
300 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  41.58 
 
 
310 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  38.87 
 
 
320 aa  215  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  41.95 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  40.34 
 
 
293 aa  211  9e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  39.73 
 
 
464 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  41 
 
 
299 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  40.13 
 
 
309 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  43.55 
 
 
305 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.52 
 
 
321 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  41.64 
 
 
311 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.67 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.22 
 
 
297 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  39.39 
 
 
499 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  39.39 
 
 
499 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  39.39 
 
 
499 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  37.83 
 
 
313 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  40.88 
 
 
489 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5305  hypothetical protein  43.29 
 
 
305 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2865  domain of unknown function DUF1731  43.23 
 
 
302 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  37.97 
 
 
499 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.33 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  38.69 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>