53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1460 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  98.74 
 
 
250 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  93.28 
 
 
238 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  89.92 
 
 
238 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  89.5 
 
 
238 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  88.66 
 
 
238 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  89.08 
 
 
238 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  88.24 
 
 
238 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  67.65 
 
 
238 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  68.91 
 
 
238 aa  349  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  65.13 
 
 
236 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  64.35 
 
 
238 aa  325  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  53.25 
 
 
239 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  51.08 
 
 
239 aa  254  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  48.54 
 
 
239 aa  245  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  52.44 
 
 
228 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  46.81 
 
 
241 aa  226  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  46.44 
 
 
239 aa  224  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  46.75 
 
 
245 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  47.39 
 
 
262 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  46.32 
 
 
239 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  48.05 
 
 
238 aa  215  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  45.02 
 
 
239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  46.29 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  44.16 
 
 
247 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  45.96 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  45.96 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  45.53 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  39.58 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  36.44 
 
 
237 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  42.5 
 
 
232 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  36.67 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  32.49 
 
 
236 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  30.24 
 
 
231 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  31.42 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  29.15 
 
 
246 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  31.32 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  26.85 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  32.23 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  27.19 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  23.62 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  23.62 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  22.97 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  24.3 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  26.45 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  25.44 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  21.92 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  21.46 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  23.66 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  20.09 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  23.89 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>