156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1391 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 		 337 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  48.48 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  48.48 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.55 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  48.06 
 
 		 344 aa  315  6e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  45.9 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.08 
 
 		 354 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  44.44 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  44.68 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  44.88 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.29 
 
 		 350 aa  298  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.91 
 
 		 343 aa  296  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  48.65 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  46.83 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.42 
 
 		 355 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.53 
 
 		 349 aa  295  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.78 
 
 		 349 aa  295  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  46.65 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.9 
 
 		 358 aa  292  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.67 
 
 		 343 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  45.59 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  44.11 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.07 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.48 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  44.68 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  46.5 
 
 		 350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.76 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  45.9 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  45.95 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.25 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  44.48 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  43.03 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  42.81 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  43.12 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  43.48 
 
 		 349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  42.02 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  42.3 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  39.52 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  42.64 
 
 		 350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  38.99 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  43.37 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.88 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  44.58 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  43.33 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.94 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  37.9 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  39.01 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  41.02 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.43 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  37.03 
 
 		 346 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  39.13 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  41.12 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  39.38 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.31 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  37.76 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  39.45 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  37.09 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  35.93 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.83 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.1 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  38.04 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.1 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.82 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.82 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  36.04 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  36.34 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  36.61 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  37.46 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.02 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  36.67 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  35.74 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.93 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  34.22 
 
 		 348 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  34.94 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  37.43 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.44 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  35.31 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  35.31 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.82 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.91 
 
 		 350 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.54 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  35.61 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  36.11 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 749 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.97 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.51 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  35.69 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  35.33 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  37.05 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.13 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.67 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  35.67 
 
 		 748 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.65 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3681  N-acetylneuraminate synthase  31.01 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.66 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3448  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.37 
 
 		 749 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2668  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.37 
 
 		 749 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.78 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  33.43 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>