155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1351 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  99.68 
 
 
316 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  100 
 
 
316 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  91.26 
 
 
320 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  84.23 
 
 
316 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  72.32 
 
 
338 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  71.65 
 
 
318 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  68.24 
 
 
338 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  68.24 
 
 
338 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  67.92 
 
 
338 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  54.74 
 
 
334 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  52.8 
 
 
324 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  55.21 
 
 
403 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  56.85 
 
 
339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  51.06 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  50.2 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  48.64 
 
 
300 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  35.66 
 
 
266 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  36.33 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  32.66 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  31.08 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  35.83 
 
 
260 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  31.58 
 
 
262 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  32.26 
 
 
266 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  34.76 
 
 
295 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  37.06 
 
 
307 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.83 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
243 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  33.74 
 
 
228 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  33.13 
 
 
236 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  31.9 
 
 
228 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.95 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
228 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  29.41 
 
 
240 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  30.46 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  27.36 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  29.44 
 
 
251 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  30.29 
 
 
241 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  31.28 
 
 
245 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.47 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  29.19 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  28.89 
 
 
231 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  27.01 
 
 
238 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  33.88 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  29.27 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  30.22 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  25.1 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.29 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  29.29 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  29.63 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  29.41 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  29.65 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  27.33 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.79 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  28.8 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  28.64 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  26.72 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  29.76 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  27.05 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  26.34 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  29.03 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  23.83 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.06 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  28.19 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.47 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  27.1 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  26.16 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  23.04 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  26.16 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  28.04 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  25.14 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  28 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  25.44 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  26.63 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.54 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  24.02 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  25.16 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  22.75 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  25.16 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>