More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1341 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  95.93 
 
 
468 aa  848    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
467 aa  903    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  58.65 
 
 
393 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  54.64 
 
 
484 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  54.24 
 
 
485 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  53.47 
 
 
482 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  53.06 
 
 
481 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  48.95 
 
 
516 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  48.18 
 
 
517 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  46.95 
 
 
492 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  47.87 
 
 
488 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  44.79 
 
 
492 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  45.84 
 
 
483 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  43.65 
 
 
493 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  45.65 
 
 
377 aa  322  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  45.44 
 
 
377 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  42.95 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  42.77 
 
 
497 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  43.46 
 
 
384 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  41.72 
 
 
475 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  41.57 
 
 
501 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  39.96 
 
 
378 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  82.94 
 
 
394 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.03 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  41.13 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  38.84 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  39.45 
 
 
488 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  39.76 
 
 
486 aa  256  6e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  36.17 
 
 
493 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  35.97 
 
 
493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  38.98 
 
 
437 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  36.61 
 
 
498 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  65.37 
 
 
687 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  36.81 
 
 
469 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  58.1 
 
 
387 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  34.83 
 
 
383 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  54.36 
 
 
494 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  67.06 
 
 
377 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  67.06 
 
 
377 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  54.39 
 
 
377 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  46.11 
 
 
377 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  65.87 
 
 
376 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  65.66 
 
 
375 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  64.53 
 
 
490 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  65.87 
 
 
379 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  64.67 
 
 
402 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  35.71 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.07 
 
 
271 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.07 
 
 
271 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  47.73 
 
 
377 aa  216  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  34.48 
 
 
513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  50.41 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  64.67 
 
 
377 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  66.47 
 
 
379 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  63.47 
 
 
377 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  62.57 
 
 
270 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  56.68 
 
 
475 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  46.74 
 
 
384 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  64.12 
 
 
271 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  64.12 
 
 
271 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  62.07 
 
 
272 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  34.87 
 
 
505 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  62.07 
 
 
272 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  66.46 
 
 
271 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  66.46 
 
 
271 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  62.43 
 
 
276 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  61.18 
 
 
492 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  66.26 
 
 
273 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
273 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  62.43 
 
 
274 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  63.47 
 
 
376 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  58.93 
 
 
378 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  64.81 
 
 
273 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  62.78 
 
 
271 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  61.76 
 
 
275 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.36 
 
 
294 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  31.92 
 
 
519 aa  202  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  61.08 
 
 
294 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  60.25 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  48.97 
 
 
609 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  64.2 
 
 
273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  61.18 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  63.47 
 
 
274 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  60.23 
 
 
272 aa  200  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 
492 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  52.94 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  31.98 
 
 
518 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  57.89 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  62.13 
 
 
273 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  53.92 
 
 
388 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  50.61 
 
 
282 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  60.23 
 
 
272 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  63.58 
 
 
272 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.89 
 
 
280 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  63.58 
 
 
273 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  35.39 
 
 
481 aa  193  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  62.35 
 
 
272 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  61.73 
 
 
272 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  58.52 
 
 
273 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  33.97 
 
 
420 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>