More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1340 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  95.93 
 
 
467 aa  848  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  905  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  55.71 
 
 
485 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  54.44 
 
 
484 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  57.38 
 
 
393 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  52.04 
 
 
481 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  52.34 
 
 
482 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  48.85 
 
 
517 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  48.28 
 
 
516 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  47.26 
 
 
488 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  46.67 
 
 
492 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  44.2 
 
 
492 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  45.64 
 
 
483 aa  326  4e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  43.85 
 
 
493 aa  322  1e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  45.76 
 
 
377 aa  320  2e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  45.55 
 
 
377 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  42.64 
 
 
376 aa  305  1e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  41.57 
 
 
497 aa  303  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  43.46 
 
 
384 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  42.52 
 
 
384 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  40.38 
 
 
378 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  41.05 
 
 
475 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  40.98 
 
 
501 aa  285  1e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  82.35 
 
 
394 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  39.64 
 
 
492 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  41.75 
 
 
462 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.24 
 
 
405 aa  273  4e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  39.64 
 
 
488 aa  260  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  39.55 
 
 
486 aa  255  1e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  36.17 
 
 
493 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  35.97 
 
 
493 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  1.74414e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  36.61 
 
 
498 aa  241  3e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  37.01 
 
 
469 aa  239  6e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  38.98 
 
 
437 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  65.37 
 
 
687 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  55.65 
 
 
377 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  58.1 
 
 
387 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  68.24 
 
 
377 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  68.24 
 
 
377 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  35.04 
 
 
383 aa  226  5e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.59197e-07 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  46.73 
 
 
377 aa  224  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  53.94 
 
 
494 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  66.47 
 
 
402 aa  221  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  66.27 
 
 
375 aa  221  2e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  66.47 
 
 
379 aa  221  2e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  65.87 
 
 
376 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  48.7 
 
 
377 aa  217  3e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  58.55 
 
 
271 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  58.55 
 
 
271 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  66.47 
 
 
377 aa  216  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  63.95 
 
 
490 aa  214  3e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  50.83 
 
 
506 aa  214  4e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  64.07 
 
 
377 aa  213  5e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 
271 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  65.84 
 
 
271 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  65.84 
 
 
271 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 
271 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  35.04 
 
 
420 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  65.27 
 
 
379 aa  210  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  61.45 
 
 
270 aa  210  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
272 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
272 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  62.7 
 
 
294 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  34.1 
 
 
513 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  64.16 
 
 
274 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  61.76 
 
 
492 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  63.35 
 
 
378 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.92 
 
 
294 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  62.94 
 
 
275 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  55.08 
 
 
475 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  64.67 
 
 
274 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  62.35 
 
 
275 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  65.22 
 
 
376 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  60.25 
 
 
385 aa  203  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  61.85 
 
 
276 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  64.5 
 
 
273 aa  202  1e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  64.81 
 
 
273 aa  201  2e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  64.81 
 
 
273 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  49.79 
 
 
609 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  62.22 
 
 
271 aa  200  4e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  63.58 
 
 
273 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  65.43 
 
 
272 aa  198  1e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  31.73 
 
 
519 aa  199  1e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  65 
 
 
273 aa  199  1e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  36.43 
 
 
506 aa  198  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  53.46 
 
 
388 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  62.5 
 
 
492 aa  197  4e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  60.85 
 
 
272 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  64.81 
 
 
273 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  59.09 
 
 
272 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  31.98 
 
 
518 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  57.89 
 
 
282 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  64.2 
 
 
272 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  66.03 
 
 
273 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  60.38 
 
 
404 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  62.96 
 
 
272 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  62.35 
 
 
272 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.89 
 
 
280 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  54.4 
 
 
319 aa  191  3e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
273 aa  191  3e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>