More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1339 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  97.51 
 
 
402 aa  784  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
402 aa  803  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  63.28 
 
 
401 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  62.47 
 
 
403 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  61.73 
 
 
403 aa  506  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  62.22 
 
 
403 aa  505  1e-142  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  61.98 
 
 
403 aa  505  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  61.73 
 
 
403 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  60.99 
 
 
403 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  60.25 
 
 
403 aa  494  1e-138  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  57.07 
 
 
401 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  56.82 
 
 
400 aa  468  1e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  56.47 
 
 
396 aa  465  1e-130  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  57.57 
 
 
396 aa  466  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  57.07 
 
 
396 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  50.37 
 
 
400 aa  407  1e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  34.63 
 
 
406 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  33.87 
 
 
397 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.39 
 
 
408 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  30.27 
 
 
397 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.41 
 
 
410 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.34 
 
 
420 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
396 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.88 
 
 
411 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.12 
 
 
411 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 
397 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 
400 aa  163  5e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.73 
 
 
400 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.63 
 
 
400 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.86 
 
 
439 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  27.75 
 
 
416 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  30.64 
 
 
403 aa  149  1e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.76 
 
 
408 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
401 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
401 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
412 aa  142  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  27.8 
 
 
398 aa  140  5e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 
404 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  26.07 
 
 
405 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.13698e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  25.81 
 
 
433 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 
404 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  28.92 
 
 
401 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  28.64 
 
 
407 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 
406 aa  128  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  27.79 
 
 
417 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  28.4 
 
 
407 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 
410 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  26.08 
 
 
410 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.51 
 
 
411 aa  122  1e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.06 
 
 
410 aa  122  1e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  25.82 
 
 
413 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
411 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
411 aa  119  1e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  26.37 
 
 
413 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
411 aa  114  2e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.17 
 
 
428 aa  114  4e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  32.64 
 
 
532 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  25.91 
 
 
410 aa  113  7e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  25.37 
 
 
399 aa  112  1e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  26.35 
 
 
420 aa  109  7e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.8 
 
 
562 aa  109  9e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  25.84 
 
 
413 aa  109  9e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  26.12 
 
 
420 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
521 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  35.85 
 
 
524 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  32.45 
 
 
523 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 
302 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  29.94 
 
 
305 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
300 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 
311 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  26.86 
 
 
530 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  30.51 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  27.97 
 
 
521 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  31.69 
 
 
297 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  36.13 
 
 
317 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  25.31 
 
 
341 aa  93.6  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  28.8 
 
 
305 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.91 
 
 
326 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  29.35 
 
 
305 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  35.48 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
317 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  24.82 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  7.47775e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  35.48 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  28.81 
 
 
299 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
317 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  34.81 
 
 
317 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>