60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1314 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  96.3 
 
 		 81 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  88.89 
 
 		 81 aa  151  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  86.42 
 
 		 81 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  86.42 
 
 		 81 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  86.42 
 
 		 81 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  86.42 
 
 		 81 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  67.11 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  59.74 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  51.28 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  49.37 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1754  hypothetical protein  50.65 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.427593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  48.68 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  48.68 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  48.68 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1538  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0059018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  44.16 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  46.58 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  39.44 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  40.26 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  44.62 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  42.47 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  36 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  35.06 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  39.73 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  38.96 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  33.8 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  35.06 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  35.62 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  37.68 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  38.46 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  31.58 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  34.25 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.18 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  35.62 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  32.39 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  36.23 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  32.47 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  36.92 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  28.57 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  34.33 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  41.2  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  39.68 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 74 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>