122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1281 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  98.53 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  97.08 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  87.18 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  78.83 
 
 		 274 aa  474  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  76.28 
 
 		 274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  0.00000000000208839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  76.28 
 
 		 274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  75.91 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  75.91 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  62.77 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  66.06 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  63.5 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  61.31 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  62.04 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  60.95 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  54.04 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  62.86 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  55.68 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  48.18 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  46.56 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  44.24 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  47.52 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  44.58 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  42.52 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  39.85 
 
 		 277 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  38.91 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  40.96 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  40 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  38.22 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  39.15 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  37.25 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  38.7 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  38.1 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  38.24 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  38.24 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  38.7 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  38.4 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  39.08 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  37.82 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  35.46 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  34.8 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  38.52 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  37.82 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  35.85 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  35.58 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  38.11 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  37.7 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  37.69 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  38.73 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  36.73 
 
 		 251 aa  152  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  36.86 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  36.84 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  35.66 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  35.57 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1395  hypothetical protein  37.1 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  34.73 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  40.58 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  34.88 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  35.27 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  36.19 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  34.88 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  34.92 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0013  hypothetical protein  33.86 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  35.29 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  34.13 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1447  protein of unknown function DUF980  33.33 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  33.85 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  32.52 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1027  protein of unknown function DUF980  34.59 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.196659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  35.34 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  34.89 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2096  protein of unknown function DUF980  35.12 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1618  hypothetical protein  35.12 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1184  hypothetical protein  35.71 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0742773  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2561  hypothetical protein  34.51 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00550602  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1119  protein of unknown function DUF980  36.09 
 
 		 288 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02840  hypothetical protein  35.82 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  30.63 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  34.67 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000683564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  34.31 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2502  hypothetical protein  32.74 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  34.22 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  34.22 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  34.22 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2303  hypothetical protein  34.22 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000109705  hitchhiker  7.98783e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2711  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1148  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113311  hitchhiker  0.0000000000000428732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01890  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000112317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1676  protein of unknown function DUF980  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0614873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2259  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000106573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1670  hypothetical protein  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  normal  0.343591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0993  Mlc titration factor MtfA  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000614673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2819  Mlc titration factor MtfA  31.71 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000714473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>