More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1099 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 255 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  99.22 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  95.29 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  85.49 
 
 		 256 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  77.95 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  77.56 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  77.56 
 
 		 254 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  76.77 
 
 		 254 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  75.2 
 
 		 254 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  56.69 
 
 		 278 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  54.72 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3051  TatD-related deoxyribonuclease  48.82 
 
 		 257 aa  264  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000137403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0999  TatD-related deoxyribonuclease  52.16 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000160958  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  52.94 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2818  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000169535  hitchhiker  0.0000498111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0970  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0121971  decreased coverage  0.000171959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  41.77 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  39.92 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  39.15 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  39.15 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  39.15 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.53 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.53 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  37.8 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  38.76 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.53 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  39.92 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  37.55 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  37.55 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  37.55 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  37.55 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  37.65 
 
 		 258 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  37.16 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  38.04 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.14 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  35.97 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  35.02 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  37.98 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  38.79 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  34.48 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  36.96 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  40.36 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  33.99 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.21 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  35.89 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.88 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  40.86 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  36.08 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  34.51 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  37.33 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  37.78 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1109  TatD family hydrolase  32.32 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  40.36 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  35.77 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  35.83 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  40.36 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  40.36 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  33.98 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  40.36 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  40.36 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  38.94 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  35.51 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.24 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  35.77 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  36.78 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  39.91 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  39.91 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  39.64 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  34.38 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.38 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  35 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  34.88 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  35.38 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.98 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>