More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0945 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0894  catalase  94.02 
 
 
491 aa  971    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  97.12 
 
 
486 aa  997    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  93.61 
 
 
491 aa  967    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  86.07 
 
 
493 aa  901    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  93.61 
 
 
491 aa  970    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  99.79 
 
 
486 aa  1017    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  100 
 
 
486 aa  1018    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  87.94 
 
 
486 aa  904    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  83.74 
 
 
487 aa  869    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  98.77 
 
 
486 aa  1008    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  86.8 
 
 
488 aa  899    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  92.18 
 
 
486 aa  949    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  93.81 
 
 
491 aa  971    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  58.76 
 
 
485 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  60.62 
 
 
479 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  60.62 
 
 
479 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  60 
 
 
481 aa  594  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  60.95 
 
 
479 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  59.84 
 
 
484 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  60.12 
 
 
479 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  59.71 
 
 
498 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  58.21 
 
 
480 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  58.3 
 
 
484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  57.44 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  56.61 
 
 
490 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  56.61 
 
 
490 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  56.2 
 
 
490 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  55.78 
 
 
493 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  56.49 
 
 
501 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  55.77 
 
 
488 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  55.42 
 
 
499 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  55.77 
 
 
488 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  54.81 
 
 
486 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  53.91 
 
 
485 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  54.66 
 
 
487 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  55 
 
 
499 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  55 
 
 
499 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  54.66 
 
 
504 aa  542  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  54.95 
 
 
485 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  54.12 
 
 
484 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  54.83 
 
 
496 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  54.3 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  54.79 
 
 
477 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  53.5 
 
 
484 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  53.81 
 
 
484 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  53.56 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  53.59 
 
 
478 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  55.03 
 
 
483 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  54.1 
 
 
482 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  53.73 
 
 
479 aa  531  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  53.73 
 
 
479 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  53.73 
 
 
479 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  54.62 
 
 
504 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  54.23 
 
 
482 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  54.79 
 
 
494 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  52.99 
 
 
481 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  52.98 
 
 
479 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  53.24 
 
 
498 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  53.33 
 
 
485 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  53.18 
 
 
478 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  54.92 
 
 
485 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  52.8 
 
 
507 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  55.74 
 
 
474 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  52.85 
 
 
483 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  54.04 
 
 
487 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  55.74 
 
 
474 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  52.24 
 
 
501 aa  522  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  53.2 
 
 
481 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  55.74 
 
 
474 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  52.35 
 
 
480 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  51.76 
 
 
480 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  54.26 
 
 
474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  53.61 
 
 
514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  53.33 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  53.11 
 
 
499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  54.36 
 
 
480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  52.59 
 
 
500 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  52.58 
 
 
494 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  52.47 
 
 
478 aa  513  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  52.59 
 
 
506 aa  511  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  50 
 
 
483 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  52.37 
 
 
499 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  52.77 
 
 
483 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  51.84 
 
 
499 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  52.05 
 
 
479 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  52.49 
 
 
490 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  53.81 
 
 
547 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  52.57 
 
 
483 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  53.12 
 
 
555 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  50.3 
 
 
505 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  52.04 
 
 
493 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  50.3 
 
 
505 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  52.9 
 
 
517 aa  500  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  49.6 
 
 
504 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  52.8 
 
 
499 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  50.41 
 
 
482 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  49.79 
 
 
483 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1101  Catalase  50.51 
 
 
481 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.384767  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  50.41 
 
 
510 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  57.7 
 
 
556 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>