63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0871 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  98.85 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  82.77 
 
 		 270 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  82.4 
 
 		 267 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  82.02 
 
 		 269 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  87.06 
 
 		 173 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  49.06 
 
 		 278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  55.17 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  57.26 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  44.59 
 
 		 171 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3437  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  52.43 
 
 		 131 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  50.51 
 
 		 135 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  45.08 
 
 		 141 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  50.96 
 
 		 149 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  50.96 
 
 		 149 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  50.96 
 
 		 149 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  50.96 
 
 		 149 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  43.55 
 
 		 138 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  99  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  43 
 
 		 148 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  43 
 
 		 148 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  41 
 
 		 147 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  43 
 
 		 135 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  34.58 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  32.35 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  29.47 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  33.66 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  32.99 
 
 		 159 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  34.48 
 
 		 131 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  35.85 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  28.12 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  28.85 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  36.05 
 
 		 131 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  31.58 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28.87 
 
 		 157 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  28.28 
 
 		 113 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  36.05 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  24.27 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  24.53 
 
 		 122 aa  47  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  29.29 
 
 		 131 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  26.32 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  25.23 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  32.29 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  31.25 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29.79 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  28.3 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.13 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  34.25 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  28.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.91 
 
 		 139 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  26.6 
 
 		 185 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0524878  normal  0.458715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  27.66 
 
 		 168 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>