42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0694 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  95.24 
 
 		 1323 bp  2123    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  95.01 
 
 		 1323 bp  2099    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  95.62 
 
 		 1323 bp  2163    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  95.01 
 
 		 1323 bp  2099    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  95.01 
 
 		 1323 bp  2099    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  94.78 
 
 		 1323 bp  2076    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3484    95.07 
 
 		 1993 bp  2129    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  95.01 
 
 		 1323 bp  2099    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  94.94 
 
 		 1323 bp  2091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  95.54 
 
 		 1323 bp  2155    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  95.38 
 
 		 1341 bp  2167    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  95.46 
 
 		 1323 bp  2147    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  95.46 
 
 		 1323 bp  2147    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  95.39 
 
 		 1323 bp  2139    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  95.37 
 
 		 1137 bp  1816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  95.3 
 
 		 1341 bp  2159    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0694    100 
 
 		 1341 bp  2658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00319575  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  91.31 
 
 		 1323 bp  1711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  91.46 
 
 		 1323 bp  1727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  91.46 
 
 		 1323 bp  1727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  91.46 
 
 		 1323 bp  1727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0727    94.7 
 
 		 162 bp  206  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  90.24 
 
 		 1188 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  90.24 
 
 		 1203 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>