139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0641 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  94.05 
 
 		 588 aa  1095    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  74.79 
 
 		 585 aa  924    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  99.66 
 
 		 588 aa  1211    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 588 aa  1214    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  77.21 
 
 		 587 aa  913    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  98.47 
 
 		 588 aa  1197    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2924  alkaline phosphatase, putative  77.38 
 
 		 589 aa  927    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.626118  normal  0.330722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  92.16 
 
 		 588 aa  1093    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0832  alkaline phosphatase  76.66 
 
 		 590 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3184  alkaline phosphatase  89.29 
 
 		 587 aa  1010    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  92.16 
 
 		 588 aa  1093    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  72.33 
 
 		 589 aa  898    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  73.15 
 
 		 589 aa  883    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  92.16 
 
 		 588 aa  1093    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0959  alkaline phosphatase  74.15 
 
 		 589 aa  854    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  91.82 
 
 		 588 aa  1091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  54.36 
 
 		 576 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  53.1 
 
 		 583 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  52.92 
 
 		 617 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  52.92 
 
 		 606 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  47.66 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  48.07 
 
 		 557 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  46.29 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  45.54 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  42.9 
 
 		 600 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  40.91 
 
 		 582 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  38.42 
 
 		 574 aa  343  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  34.2 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2404  alkaline phosphatase  36.03 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.79 
 
 		 555 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  49.39 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  35.2 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  36.91 
 
 		 550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  37 
 
 		 523 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  34.72 
 
 		 540 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  34.32 
 
 		 540 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  33.91 
 
 		 541 aa  296  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  33 
 
 		 541 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  32.6 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  31.68 
 
 		 528 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08622  alkaline phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08710)  32.48 
 
 		 641 aa  237  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  30.09 
 
 		 531 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  34.51 
 
 		 523 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  30.77 
 
 		 529 aa  231  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  31.78 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  30.41 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 534 aa  227  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  31.97 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  31.5 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  39.37 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  30.66 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  31.54 
 
 		 531 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  30.25 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  35.19 
 
 		 540 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  30.37 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39432  predicted protein  29.56 
 
 		 791 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.810038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  30.36 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  35.08 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  37.18 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  31.38 
 
 		 528 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.63 
 
 		 524 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  28.82 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.84 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  31.71 
 
 		 618 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  38.22 
 
 		 523 aa  206  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  31.21 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  34.37 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 		 670 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  29.31 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  36.36 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  30.56 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  35.82 
 
 		 523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  36.81 
 
 		 529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 545 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  36.26 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  35.16 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  28.68 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1157  alkaline phosphatase  37.05 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0769586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0310  alkaline phosphatase  34.1 
 
 		 494 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  31.77 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  36.81 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  28.57 
 
 		 529 aa  187  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  28.5 
 
 		 525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  36.57 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  30.25 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5492  Alkaline phosphatase  30.51 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.201843  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  34.07 
 
 		 538 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  29.69 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0541  alkaline phosphatase  31.14 
 
 		 515 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  26.91 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1625  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 		 521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.127338  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  28.38 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  28.72 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1411  alkaline phosphatase  30.56 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  36.19 
 
 		 710 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  31.65 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0042  Alkaline phosphatase  32.45 
 
 		 744 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3950  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  33 
 
 		 689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.028055  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1502  Alkaline phosphatase  27.59 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>