More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0635 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  93.75 
 
 		 720 aa  1413    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  88.75 
 
 		 720 aa  1345    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  99.44 
 
 		 720 aa  1477    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 720 aa  1481    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28.23 
 
 		 848 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  22.85 
 
 		 833 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  22.64 
 
 		 719 aa  127  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 778 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  21.98 
 
 		 750 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  21.78 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 733 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.01 
 
 		 661 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 661 aa  94.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  22.9 
 
 		 700 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 760 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  20.47 
 
 		 773 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.93 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  22.56 
 
 		 687 aa  88.6  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 748 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  21.31 
 
 		 726 aa  87.4  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  32.54 
 
 		 611 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.77 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.48 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.12 
 
 		 666 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.38 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.19 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.12 
 
 		 666 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  24.11 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  36.67 
 
 		 620 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 662 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.04 
 
 		 633 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 652 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  23.52 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  29.92 
 
 		 659 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 697 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.76 
 
 		 663 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 649 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 679 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 653 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 653 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 634 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.5 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  22.7 
 
 		 783 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.89 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.31 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  38.74 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  30.48 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.06 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 691 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.5 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 710 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.21 
 
 		 623 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  23.24 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  23.24 
 
 		 751 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.48 
 
 		 613 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 617 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 669 aa  71.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  20.67 
 
 		 721 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.71 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.65 
 
 		 1023 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 699 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  23.11 
 
 		 751 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 707 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  31.94 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  22.98 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 907 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 668 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  25.68 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  22.98 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  22.03 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  32.32 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  31.06 
 
 		 647 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>