156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0388 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
249 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  99.6 
 
 
249 aa  511  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  99.2 
 
 
249 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  96.77 
 
 
262 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0489  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  93.57 
 
 
249 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  89.96 
 
 
249 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  89.96 
 
 
262 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  90.36 
 
 
262 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  89.56 
 
 
262 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.67 
 
 
262 aa  332  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  68.35 
 
 
254 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.6 
 
 
256 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  64.56 
 
 
250 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.67 
 
 
254 aa  322  3e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  61.18 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.22 
 
 
218 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  39.59 
 
 
275 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  39.47 
 
 
263 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3589  cell division protein FtsQ  38.52 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3777  cell division protein FtsQ  38.93 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0326352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  38.2 
 
 
284 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  37.23 
 
 
283 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  38.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  38.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  38.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  38.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  38.96 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  38.24 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  39.41 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0651  cell division protein FtsQ  39.15 
 
 
284 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0684604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4462  cell division protein FtsQ  35.04 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1150  cell division protein FtsQ  33.2 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  39.27 
 
 
286 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  37.07 
 
 
276 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  37.27 
 
 
256 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  38.68 
 
 
260 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  38.5 
 
 
260 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  36.71 
 
 
263 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  37.33 
 
 
289 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.05 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.11 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.33 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.33 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  35.44 
 
 
288 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  36.32 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  33.92 
 
 
287 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  35.71 
 
 
289 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  33.48 
 
 
287 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  36.57 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34.67 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0361  cell division protein  33.19 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00756063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0773  cell division protein FtsQ  38.5 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  37 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  32.14 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  35.1 
 
 
243 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  35.1 
 
 
243 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.58 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.79 
 
 
271 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  35.05 
 
 
279 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  37.44 
 
 
246 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  34.36 
 
 
243 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1966  cell division protein FtsQ  32.02 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2045  cell division protein  32.02 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000010685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  30 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  34.91 
 
 
287 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  33.84 
 
 
236 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  31.36 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0381  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.11 
 
 
280 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00296108  normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0202  cell division protein FtsQ  29.11 
 
 
280 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  34.63 
 
 
268 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0922  cell division protein FtsQ  34.48 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130342  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  30.62 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0184  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.33 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000203448  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  30.62 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  32.08 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.08 
 
 
250 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.08 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2187  cell division protein FtsQ  35.29 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.56 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.83 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3422  cell division protein FtsQ  34.16 
 
 
261 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0109041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03255  cell division protein  37.96 
 
 
173 aa  108  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0023764  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.02 
 
 
226 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000621629  unclonable  0.00000000000366922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  31.12 
 
 
250 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3541  cell division protein FtsQ  31.12 
 
 
250 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3522  cell division protein FtsQ  31.12 
 
 
250 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3547  cell division protein FtsQ  31.12 
 
 
250 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  33.17 
 
 
267 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2548  cell division protein FtsQ  30.61 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  29.15 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3125  cell division protein FtsQ  35.23 
 
 
300 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1328  cell division protein FtsQ  30.61 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>