119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0104 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  98.02 
 
 		 404 aa  795    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  99.26 
 
 		 404 aa  802    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  100 
 
 		 404 aa  809    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  99.01 
 
 		 404 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  78.71 
 
 		 403 aa  641    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  95.05 
 
 		 404 aa  758    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  79.16 
 
 		 404 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  81.5 
 
 		 404 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  95.3 
 
 		 404 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  78.91 
 
 		 404 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  78.91 
 
 		 404 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  79.28 
 
 		 401 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  78.77 
 
 		 401 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  79.44 
 
 		 401 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  79.03 
 
 		 401 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  79.44 
 
 		 401 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  95.3 
 
 		 404 aa  759    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  79.65 
 
 		 401 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  79.65 
 
 		 401 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  79.4 
 
 		 401 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  79 
 
 		 401 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  79.65 
 
 		 401 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  79.25 
 
 		 401 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  79.65 
 
 		 401 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  73.39 
 
 		 423 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  61.7 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  59.08 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  58.27 
 
 		 408 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  43.64 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  43.03 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  43.03 
 
 		 402 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  42.46 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  46.37 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  43.75 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  30.33 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.07 
 
 		 180 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.85 
 
 		 183 aa  86.3  9e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.3 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.62 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  41.18 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  41.18 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  40.2 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  40.2 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  40.2 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  40.2 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.15 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.2 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  34.64 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.75 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1636  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.55 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.39 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32 
 
 		 216 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.61 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.55 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.04 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  42.16 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  38.61 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.7 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.3 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.09 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  36.62 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  41.94 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.72 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  36.62 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.95 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  40.38 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.28 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  31.43 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  28.49 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.29 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  31.17 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.97 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  32.67 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.31 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  38.14 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.14 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  30.52 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.68 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  26.24 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.23 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.24 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.42 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4078  YeeE/YedE  28.92 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0419  YeeE/YedE  31.85 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  30.48 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  28.92 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.19 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  28.22 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.78 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  31.46 
 
 		 103 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0499  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.99 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.1 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  29.38 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.187562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1649  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.88 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203663  normal  0.0487751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>