More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0060 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0059  major facilitator transporter  88.17 
 
 		 487 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  98.96 
 
 		 482 aa  934    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0060  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0064  major facilitator transporter  87.76 
 
 		 487 aa  750    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0064  major facilitator transporter  99.59 
 
 		 482 aa  941    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000292111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0063  major facilitator superfamily MFS_1  87.76 
 
 		 487 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4295  major facilitator transporter  87.76 
 
 		 487 aa  749    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  51.91 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 680 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 505 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  34.72 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 501 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 569 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 483 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 		 565 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.73 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  34.29 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 530 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 		 593 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 		 526 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 676 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 		 528 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 530 aa  216  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 666 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  32.95 
 
 		 1062 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 		 554 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 621 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  35.02 
 
 		 513 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 682 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 682 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 682 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.05 
 
 		 685 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.68 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 850 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 592 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 524 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.71 
 
 		 504 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 504 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 697 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 650 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.26 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.49 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  31.5 
 
 		 478 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 504 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 504 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 478 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  31.26 
 
 		 478 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 478 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 		 685 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.26 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.32 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 561 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4396  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 526 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.28 
 
 		 558 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 567 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 607 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 641 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
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NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 485 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 565 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.77 
 
 		 678 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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