236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0023 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  81.67 
 
 		 480 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  81.67 
 
 		 480 aa  779    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  95.62 
 
 		 480 aa  903    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  99.58 
 
 		 480 aa  964    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 480 aa  965    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  74.79 
 
 		 480 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  83.54 
 
 		 480 aa  804    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  99.58 
 
 		 480 aa  960    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  79.58 
 
 		 480 aa  790    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  95.42 
 
 		 480 aa  899    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  95.42 
 
 		 480 aa  899    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  95.42 
 
 		 480 aa  899    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  95.42 
 
 		 480 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  93.54 
 
 		 480 aa  894    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  58.21 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  57.71 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  57.71 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  55.97 
 
 		 481 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  54.78 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  53.75 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  50.11 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  53.24 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  53.44 
 
 		 484 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  53.16 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  50.22 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  50.22 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  50.44 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  50 
 
 		 484 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  49.46 
 
 		 484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  49.79 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  48.6 
 
 		 484 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  48.6 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.73 
 
 		 490 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.44 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.75 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  42.71 
 
 		 482 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  48.89 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.61 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  41.12 
 
 		 482 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  40.83 
 
 		 485 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.36 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.73 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.57 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.11 
 
 		 466 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.87 
 
 		 500 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.21 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.42 
 
 		 478 aa  316  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.57 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.45 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.4 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  37.4 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.49 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  38.33 
 
 		 484 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.85 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.68 
 
 		 484 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.85 
 
 		 484 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  37.08 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.93 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  38.15 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.5 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.4 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.19 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  34.5 
 
 		 479 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.66 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.47 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.16 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.69 
 
 		 466 aa  282  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.36 
 
 		 485 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  35.58 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.54 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  34.56 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.49 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  36.21 
 
 		 484 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.32 
 
 		 478 aa  276  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.06 
 
 		 483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.77 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.1 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.74 
 
 		 483 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.14 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.38 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  34.38 
 
 		 476 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  34.82 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  36.2 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  33.81 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  34.45 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.16 
 
 		 485 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  33.81 
 
 		 488 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.7 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  35.67 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.81 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  34.67 
 
 		 486 aa  263  6.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  34.15 
 
 		 487 aa  262  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  33.06 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  35.77 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.84 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.38 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.22 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>