More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3842 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  909    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  910    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0104  oligopeptidase A  48.74 
 
 
674 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  61.5 
 
 
683 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  84.79 
 
 
679 aa  1173    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  57.9 
 
 
682 aa  853    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  48.11 
 
 
706 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  64.71 
 
 
683 aa  938    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  66.76 
 
 
682 aa  930    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  63.38 
 
 
682 aa  860    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  61.41 
 
 
681 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  96.61 
 
 
679 aa  1342    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  60.38 
 
 
683 aa  823    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  52.25 
 
 
683 aa  733    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  52.1 
 
 
685 aa  729    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  60.74 
 
 
683 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  64.9 
 
 
680 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3646  oligopeptidase A  51.4 
 
 
684 aa  673    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  47.97 
 
 
704 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  49.35 
 
 
692 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  50.43 
 
 
701 aa  680    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  49.78 
 
 
695 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  65.04 
 
 
680 aa  916    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  61.12 
 
 
695 aa  825    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  61.12 
 
 
679 aa  860    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  910    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  61.32 
 
 
692 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  51.74 
 
 
714 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  50 
 
 
695 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  910    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  84.68 
 
 
679 aa  1189    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  52.2 
 
 
683 aa  736    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  50.74 
 
 
676 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  61.65 
 
 
695 aa  828    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  51 
 
 
703 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  64.9 
 
 
680 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  49.13 
 
 
700 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  59.08 
 
 
686 aa  854    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  61.23 
 
 
676 aa  860    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  51.25 
 
 
677 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  64.9 
 
 
680 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  909    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  56.53 
 
 
685 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  57.29 
 
 
681 aa  810    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  51.42 
 
 
677 aa  726    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  51.18 
 
 
679 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  67.01 
 
 
678 aa  941    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  50.29 
 
 
716 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  64.9 
 
 
680 aa  911    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  51.57 
 
 
677 aa  728    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  83.95 
 
 
679 aa  1181    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  94.55 
 
 
679 aa  1319    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  57.84 
 
 
694 aa  801    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  49.05 
 
 
699 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  64.9 
 
 
680 aa  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  47.96 
 
 
700 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  57.01 
 
 
695 aa  803    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  67.26 
 
 
680 aa  932    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  61.65 
 
 
695 aa  829    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  50.22 
 
 
704 aa  692    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  67.79 
 
 
680 aa  952    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  82.13 
 
 
679 aa  1144    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  67.46 
 
 
680 aa  951    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0089  oligopeptidase A  48.6 
 
 
674 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  62.74 
 
 
679 aa  895    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  51.18 
 
 
674 aa  675    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  68.38 
 
 
680 aa  931    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  94.11 
 
 
679 aa  1314    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  100 
 
 
679 aa  1411    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  64.31 
 
 
680 aa  909    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  67.11 
 
 
680 aa  931    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  66.37 
 
 
680 aa  943    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  99.56 
 
 
679 aa  1404    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  57.61 
 
 
679 aa  813    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  64.6 
 
 
680 aa  907    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  61.82 
 
 
681 aa  834    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  82.62 
 
 
679 aa  1170    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  50.36 
 
 
702 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  50.07 
 
 
695 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  62 
 
 
681 aa  849    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  50.74 
 
 
685 aa  714    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  50.22 
 
 
695 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  64.75 
 
 
680 aa  910    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  94.7 
 
 
679 aa  1322    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  82.72 
 
 
679 aa  1161    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  98.97 
 
 
679 aa  1394    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  49.2 
 
 
699 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  94.11 
 
 
679 aa  1315    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  94.4 
 
 
679 aa  1319    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  67.5 
 
 
695 aa  953    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  80.65 
 
 
678 aa  1137    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  65.25 
 
 
683 aa  909    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>