More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3803 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  91.47 
 
 
645 aa  1210    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
645 aa  1332    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  87.6 
 
 
645 aa  1186    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.15 
 
 
644 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  87.6 
 
 
645 aa  1182    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  87.6 
 
 
645 aa  1184    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.36 
 
 
634 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  32.13 
 
 
655 aa  272  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  31.73 
 
 
640 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
645 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
656 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
665 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.89 
 
 
688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.55 
 
 
642 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.99 
 
 
662 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 
665 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.72 
 
 
662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.72 
 
 
662 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.72 
 
 
662 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
657 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.22 
 
 
656 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.66 
 
 
662 aa  240  5.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.58 
 
 
654 aa  237  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.01 
 
 
653 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  29.09 
 
 
665 aa  236  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.7 
 
 
632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.65 
 
 
924 aa  233  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.74 
 
 
655 aa  233  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
646 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.29 
 
 
907 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.19 
 
 
644 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.44 
 
 
654 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.64 
 
 
650 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.47 
 
 
649 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.77 
 
 
685 aa  226  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.12 
 
 
632 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.14 
 
 
705 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  28.64 
 
 
636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  27.31 
 
 
662 aa  220  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.98 
 
 
649 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  27.71 
 
 
653 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
659 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 
661 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.14 
 
 
654 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
755 aa  214  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 
662 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  29.06 
 
 
759 aa  212  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.38 
 
 
629 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
652 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 
661 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.73 
 
 
653 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.81 
 
 
706 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  26.44 
 
 
642 aa  210  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.88 
 
 
642 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
688 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  27.27 
 
 
648 aa  207  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.63 
 
 
630 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.5 
 
 
677 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.58 
 
 
631 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  34.22 
 
 
634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.09 
 
 
682 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.65 
 
 
686 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
636 aa  193  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.45 
 
 
641 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.23 
 
 
626 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  26.39 
 
 
681 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
626 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 
665 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.69 
 
 
629 aa  189  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.24 
 
 
646 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.27 
 
 
623 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.04 
 
 
686 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  27.2 
 
 
694 aa  176  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.1 
 
 
626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.01 
 
 
626 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.02 
 
 
666 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.33 
 
 
632 aa  164  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.89 
 
 
731 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.94 
 
 
650 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.22 
 
 
617 aa  158  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.1 
 
 
692 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.6 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  25.71 
 
 
596 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.1 
 
 
600 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.25 
 
 
678 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.47 
 
 
638 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.48 
 
 
668 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  35.29 
 
 
661 aa  127  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  29.66 
 
 
638 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.51 
 
 
633 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 
634 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.58 
 
 
655 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.01 
 
 
596 aa  124  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.31 
 
 
652 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.74 
 
 
677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.21 
 
 
615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  34.48 
 
 
665 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.29 
 
 
629 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>