124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3655 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  97.41 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  98.26 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  95.69 
 
 		 116 aa  226  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  89.57 
 
 		 117 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  88.7 
 
 		 116 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  88.7 
 
 		 116 aa  214  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  87.07 
 
 		 116 aa  213  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  87.07 
 
 		 116 aa  208  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  68.18 
 
 		 115 aa  168  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  71.15 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  68.93 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  68.57 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  70.75 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  54.63 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  57.14 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  52.29 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  54.81 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  51.85 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  51.85 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  50.93 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  50.93 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  50.93 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  50.93 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  50.93 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  49.07 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  49.07 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  49.07 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  50.94 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  43.93 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0801  hypothetical protein  35.45 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.59 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  40.21 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  39.58 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  37.25 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  37.25 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  37.14 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  36.28 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  37.14 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  44.16 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  38.46 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  40.23 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  40.23 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  40.23 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  36.17 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  39.08 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  41.56 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  34.29 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  41.98 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  39.08 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  39.08 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  39.08 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0208  hypothetical protein  41.24 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.776323  normal  0.198508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2505  hypothetical protein  32.32 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00216917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  32.32 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  33.98 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2427  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3346  hypothetical protein  40.79 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  30.39 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  27.88 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  29.9 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  33.02 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  28.09 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  32.94 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  36.59 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  32.84 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0904  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  31.34 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  36.05 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  23.71 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  32.56 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  37.63 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  26.26 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  38.98 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  34.41 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  30 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  31.94 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  31.58 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  35.29 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  48 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  47.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  46.3 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  42.31 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>