249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3639 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  77.75 
 
 		 509 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  90.53 
 
 		 507 aa  868    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  80.88 
 
 		 497 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  80.88 
 
 		 497 aa  737    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  81.44 
 
 		 497 aa  741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 501 aa  981    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  97.8 
 
 		 501 aa  904    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  96.01 
 
 		 501 aa  859    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  80.48 
 
 		 497 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  65.08 
 
 		 497 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  64.66 
 
 		 493 aa  581  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  55.65 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  37.89 
 
 		 521 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  35.89 
 
 		 533 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.98 
 
 		 518 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  35.09 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  36.11 
 
 		 524 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  34.81 
 
 		 533 aa  289  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  37.39 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  37.39 
 
 		 522 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  36.07 
 
 		 522 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  37.61 
 
 		 526 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  36.83 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  34.71 
 
 		 528 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  37.18 
 
 		 522 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  34.58 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  34.3 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  36.72 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  38.82 
 
 		 520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  37.39 
 
 		 526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  37.14 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  36.76 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  31.86 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  32.13 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  31.73 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  31.93 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.14 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.69 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.69 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  32.16 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  30.04 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 546 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  29.47 
 
 		 507 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  30.27 
 
 		 525 aa  182  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  30.12 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  30.92 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  26.69 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  28.45 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  27.69 
 
 		 569 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.91 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  27.85 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  27.6 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  26.92 
 
 		 567 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  30.66 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  25.59 
 
 		 570 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.57 
 
 		 571 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  26.93 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.09 
 
 		 564 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.75 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  30.11 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  29.41 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  30.06 
 
 		 541 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  28.54 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  27.82 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  30.02 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  23.93 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  23.93 
 
 		 577 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  27.18 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  27.18 
 
 		 460 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  30.88 
 
 		 629 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.94 
 
 		 556 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  23.83 
 
 		 577 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.07 
 
 		 560 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.6 
 
 		 574 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.75 
 
 		 567 aa  140  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.82 
 
 		 594 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  25.54 
 
 		 466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  28.25 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  28.09 
 
 		 460 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.73 
 
 		 638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  25 
 
 		 779 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  22.31 
 
 		 501 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  22.25 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.21 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  42.04 
 
 		 201 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  25.81 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2256  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  23.66 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  24.43 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  21.74 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>