More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3613 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  100 
 
 		 207 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  99.52 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  98.55 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  97.1 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  94.2 
 
 		 224 aa  411  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  93.24 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  93.72 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  93.72 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  93.72 
 
 		 210 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  87.38 
 
 		 207 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  87.86 
 
 		 207 aa  377  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  84.06 
 
 		 210 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  83.01 
 
 		 207 aa  362  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  82.52 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  82.04 
 
 		 207 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  78.64 
 
 		 207 aa  342  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  67.8 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  67.8 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  67.8 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  67.8 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  67.8 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  67.32 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  66.34 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  287  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  65.37 
 
 		 207 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  66.02 
 
 		 213 aa  281  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  66.83 
 
 		 207 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  66.34 
 
 		 207 aa  277  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  66.34 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  62.68 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4971  guanylate kinase  64.59 
 
 		 218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  63.24 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  62.75 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  62.75 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  63.9 
 
 		 229 aa  269  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  61.35 
 
 		 207 aa  268  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  63.41 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  61.39 
 
 		 206 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  61.39 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  64.88 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  60.4 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  58.94 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  58.91 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  57.28 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  58.42 
 
 		 203 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  56.16 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  56.93 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  56.37 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  58.42 
 
 		 203 aa  240  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  55.83 
 
 		 205 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  56.44 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0110  guanylate kinase  54.87 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  54.37 
 
 		 205 aa  234  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  56.16 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  56.44 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0211  guanylate kinase  54.07 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  54.07 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  54.19 
 
 		 207 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  56.08 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  51.5 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  53.47 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  55.03 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  53.5 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  53.65 
 
 		 218 aa  218  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  51.47 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  53.5 
 
 		 227 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  53.5 
 
 		 227 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  51.72 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  57.3 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  50.74 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  50.99 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  50.75 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  49.5 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  54.5 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  52.5 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  52.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  48.77 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  51.5 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  53.72 
 
 		 206 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  55.79 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  52.78 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  49.74 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  51 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  50.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  50.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  50.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  50.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>