More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3601 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  93.5 
 
 
662 aa  1288    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.29 
 
 
662 aa  1174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.14 
 
 
662 aa  1173    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  67.67 
 
 
653 aa  949    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  84.29 
 
 
662 aa  1174    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.15 
 
 
657 aa  882    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  49.85 
 
 
653 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
661 aa  1366    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  96.07 
 
 
662 aa  1291    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  84.29 
 
 
662 aa  1173    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.63 
 
 
659 aa  1008    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  55.66 
 
 
649 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  97.13 
 
 
661 aa  1334    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.6 
 
 
654 aa  898    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  66.31 
 
 
649 aa  908    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  66.31 
 
 
654 aa  933    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.6 
 
 
654 aa  895    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  40.79 
 
 
642 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  40 
 
 
648 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.21 
 
 
623 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.31 
 
 
650 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.5 
 
 
646 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.81 
 
 
655 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.61 
 
 
640 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 
656 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
655 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.94 
 
 
665 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.78 
 
 
632 aa  260  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.5 
 
 
644 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.52 
 
 
656 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
665 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.47 
 
 
632 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  30.16 
 
 
759 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.23 
 
 
666 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.16 
 
 
705 aa  240  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.45 
 
 
646 aa  237  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.4 
 
 
924 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
644 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.87 
 
 
634 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.81 
 
 
645 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
645 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.85 
 
 
642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  28.02 
 
 
636 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.25 
 
 
652 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.36 
 
 
665 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.99 
 
 
645 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.42 
 
 
907 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.85 
 
 
645 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.7 
 
 
645 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
662 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 
755 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38 
 
 
626 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.16 
 
 
645 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.41 
 
 
631 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
626 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.96 
 
 
630 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.44 
 
 
629 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.41 
 
 
642 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.7 
 
 
629 aa  193  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
682 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  27.34 
 
 
694 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
685 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.3 
 
 
641 aa  190  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
706 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  24.96 
 
 
665 aa  188  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  30.28 
 
 
634 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.36 
 
 
636 aa  182  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.52 
 
 
692 aa  178  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.38 
 
 
626 aa  177  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.19 
 
 
626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  31.7 
 
 
681 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.65 
 
 
650 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.52 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.18 
 
 
731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.91 
 
 
686 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.15 
 
 
686 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  26.73 
 
 
653 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.72 
 
 
629 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.81 
 
 
677 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.95 
 
 
867 aa  142  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.25 
 
 
617 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.25 
 
 
615 aa  135  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.9 
 
 
594 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.19 
 
 
655 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.3 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.64 
 
 
634 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.55 
 
 
588 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.83 
 
 
683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
674 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.37 
 
 
644 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.21 
 
 
638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.5 
 
 
674 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.45 
 
 
682 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
682 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
674 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>