127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3523 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  270  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  98.44 
 
 		 128 aa  266  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  98.44 
 
 		 128 aa  265  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  95.31 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  95.31 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  95.31 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  95.31 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  96.09 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  83.2 
 
 		 131 aa  225  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  80.16 
 
 		 131 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  79.23 
 
 		 131 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  79.84 
 
 		 126 aa  217  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  80.49 
 
 		 130 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  71.09 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  62.4 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  60.5 
 
 		 124 aa  156  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  57.14 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  52.5 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  52.8 
 
 		 138 aa  136  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  54.7 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  56.52 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  50.81 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  50.81 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  55.45 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  56.36 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  52.14 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  50.81 
 
 		 137 aa  127  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  46.46 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  50.86 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  46.77 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  50.45 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  48.09 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  50.45 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  45.97 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  46.67 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  49.55 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  46.77 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  52.63 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  44.19 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  51.35 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  44.19 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  48.33 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  44.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  44.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  49.15 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  44.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  44.27 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  45.45 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  43.55 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  54.9 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  49.55 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  43.55 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  49.17 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  43.55 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  48.65 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  45.38 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  45.83 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  45.83 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  48.65 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  43.33 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  49.54 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  44.54 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  48.21 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  48.21 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  44.63 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  47.46 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  49.54 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  47.75 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  49.54 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  45.54 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  46.55 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  50 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  46.43 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  46.85 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  46.43 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  46.43 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  42.5 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  42.5 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  44.64 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  46.85 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  45.54 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  46.02 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  45.13 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  45.95 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  44.64 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  52.27 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  43.75 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  43.75 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  37.39 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  37.11 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  38.54 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  38.54 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>