167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3464 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  96.62 
 
 		 473 aa  919    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 489 aa  986    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  99.8 
 
 		 489 aa  983    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  72.57 
 
 		 477 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  99.59 
 
 		 489 aa  981    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  64.29 
 
 		 517 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  92.29 
 
 		 493 aa  886    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  73.59 
 
 		 467 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  82.24 
 
 		 464 aa  781    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  92.84 
 
 		 489 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  92.6 
 
 		 473 aa  858    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  74.95 
 
 		 473 aa  712    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  77.9 
 
 		 463 aa  699    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  92.84 
 
 		 489 aa  888    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  79.22 
 
 		 465 aa  736    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  44.8 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  44 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  42.58 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  41.53 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  41.07 
 
 		 463 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  40.54 
 
 		 471 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 		 583 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.84 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.81 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  19.91 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  18.96 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.72 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.2 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.34 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.34 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.77 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.72 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.46 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 1496 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.62 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.57 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 423 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.38 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 635 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  27.98 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 419 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.38 
 
 		 479 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.29 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>