More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3361 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  93.01 
 
 		 416 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  93.75 
 
 		 416 aa  787    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  86.51 
 
 		 416 aa  715    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  97.55 
 
 		 408 aa  793    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  93.75 
 
 		 416 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  93.75 
 
 		 416 aa  788    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  85.02 
 
 		 416 aa  722    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  85.06 
 
 		 416 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  86.99 
 
 		 416 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 416 aa  827    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  100 
 
 		 416 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  86.51 
 
 		 417 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  85.34 
 
 		 416 aa  731    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  78.43 
 
 		 409 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  99.28 
 
 		 416 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  85.82 
 
 		 416 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  93.75 
 
 		 416 aa  788    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  76.72 
 
 		 409 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0136  putative ammonium transporter  79.27 
 
 		 411 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000107717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  76.9 
 
 		 381 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  75 
 
 		 406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  68.61 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  65.12 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  66.03 
 
 		 426 aa  514  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  63.81 
 
 		 416 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  64.49 
 
 		 421 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  64.41 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  65.44 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  62.99 
 
 		 414 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  66.59 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  64.71 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0172  Rh family protein/ammonium transporter  66.18 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030893  normal  0.412572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  65.38 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2044  ammonium transporter, AmtB  63.68 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0927087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  63.08 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  62.83 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  60.93 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  64.05 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  53.17 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  52.87 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  54.34 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  53.56 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  50 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  45.78 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  44.75 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  45.06 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  40.32 
 
 		 511 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  44.25 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  39.25 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  41.41 
 
 		 468 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  40.58 
 
 		 518 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  44.15 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  41.01 
 
 		 460 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  42.55 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  43.38 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0643  Rh-like protein/ammonium transporter  38.81 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.32832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  42.62 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  40.72 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  42.62 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  42.62 
 
 		 486 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  42.46 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  43.12 
 
 		 507 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  41.37 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  42.32 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  42.66 
 
 		 506 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  40.95 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  43.27 
 
 		 507 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  41.42 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  42.35 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.28 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.28 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  42.23 
 
 		 476 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  43.9 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  43.22 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  40.72 
 
 		 483 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  41.88 
 
 		 489 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  40.33 
 
 		 487 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  42.17 
 
 		 449 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  42.21 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  41.92 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  41.92 
 
 		 496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  42.42 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  42.42 
 
 		 515 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  40.98 
 
 		 512 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  40.87 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  40.14 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  39.12 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  41.65 
 
 		 482 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  39.37 
 
 		 469 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  41.23 
 
 		 478 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  43.97 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  40.19 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  40.52 
 
 		 478 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  39.45 
 
 		 437 aa  256  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  39.01 
 
 		 433 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  40.94 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  39.14 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  38.5 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  39.9 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  36.56 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>