55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3186 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  87.95 
 
 
424 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  94.85 
 
 
428 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  96.02 
 
 
428 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  100 
 
 
428 aa  852    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  87.95 
 
 
424 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  88.43 
 
 
424 aa  700    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  88.43 
 
 
424 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  77.97 
 
 
425 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  87.71 
 
 
424 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  75.77 
 
 
421 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  75.31 
 
 
424 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3183  putative manganese transporter  76.82 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  73.58 
 
 
422 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  49.88 
 
 
421 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  48.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  48.05 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  47.29 
 
 
433 aa  354  2e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  44.74 
 
 
420 aa  315  7e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  43.97 
 
 
419 aa  315  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00602  putative manganese transporter  46.72 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  41.94 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  41.94 
 
 
428 aa  307  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  41.12 
 
 
423 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1193  manganese transporter NRAMP  41.69 
 
 
421 aa  278  9e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0146  manganese transporter NRAMP  42.96 
 
 
452 aa  273  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  38.1 
 
 
437 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  38.1 
 
 
437 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  39.11 
 
 
434 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  38.9 
 
 
435 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  40.09 
 
 
434 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  40.09 
 
 
434 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  36.36 
 
 
421 aa  257  3e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  40.1 
 
 
422 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2179  putative putative integral membrane protein  39.11 
 
 
460 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2529  putative putative integral membrane protein  38.76 
 
 
431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.656474  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  37.62 
 
 
418 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  35.97 
 
 
427 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  37.14 
 
 
433 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3850  hypothetical protein  88.46 
 
 
52 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  29.81 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  24.22 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.68 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  24.27 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.54 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3851  hypothetical protein  90.32 
 
 
48 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.88 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.32 
 
 
468 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  25.07 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  20.53 
 
 
440 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.77 
 
 
446 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  28.26 
 
 
430 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  29.38 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  29.38 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>